| 查看: 2279 | 回复: 2 | ||
zsulele金虫 (初入文坛)
|
[求助]
生物小白请教16S rDNA测序一定要做平行吗已有1人参与
|
|
本人生物小白，近期有一批底泥样需要委外检测细菌微生物多样性。 测序公司力荐做生物学重复，说这样更便于发文章。 身边有些同学做毕业论文是没做平行的。 经费有限，矛盾中~ 请教各位大牛，在需要使用数据发SCI的前提下，是否一定要做平行？ and 想了解氮磷相关微生物，V4区和V3V4区哪个更合适？ |
回复此楼» 猜你喜欢
为什么蛋白质氨基酸测定大家都测17种?
已经有5人回复
-
《灰分记：我与坩埚的“灰烬”之恋》
已经有3人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有201人回复
-
求助 食品检验工（基础知识），中国劳动社会出版社 电子版
已经有5人回复
-
胶体几丁质的结晶度？
已经有0人回复
-
诚挚招收全日制博士！！！中国农业科学院麻类研究所谭志坚研究员课题组招收博士
已经有2人回复
-
三甲基羟乙基丙二胺的合成路线
已经有5人回复
2楼2018-04-28 09:35:04
【答案】应助回帖
|
建议是做生物学重复，如果1个组，1个样本的话，举个例子，就比如一块地，有个鸟屎落在一个点上，你这个样正好取了这个点，那么你这个点本身是有差异的。建议是1组至少取3个，如果经费充足，建议是多取一些。 V4区和V3-V4区是检测细菌的通用区域，但其结果是你样本中细菌的种类和相对丰度，无法看出结果中这些细菌哪些跟磷、氮循环相关。 你如果是想了解参与氮循环、磷循环相关的微生物，建议是先寻找参与氮循环、磷循环的酶，然后找到编码这些酶的基因，根据他们的特异性引物，用二代高通量技术进行检测，得出含有这些酶的微生物。 比如固氮微生物，可以用二代高通量技术，检测nifH这个基因（这个基因具有固氮功能），那么结果就是都含有nifH的微生物，即具有固氮功能的微生物。 目前氮循环中，研究的比较透，固氮、硝化、反硝化等，涉及的基因比较多。 磷循环的话，研究的还比较少。 |
3楼2018-07-09 15:26:32