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放开我baby

新虫 (初入文坛)

[求助] 真菌鉴定 已有1人参与

我分离了一批真菌，做了ITS测序，结果到NCBI上比对，基本每一株菌都有几个相似度100%或者99%的，请问我要怎么确定到种呢？要做形态鉴定吗？如果要做的话怎么做？有没有参考资料啊？

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1楼 2018-04-27 17:00:43
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放开我baby

新虫 (初入文坛)
各位大神求帮忙啊

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2楼2018-04-27 17:07:54
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很清淡

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
snoopytbw: 金币+2, 有帮助 2018-04-28 09:46:16
形态鉴定是一方面，但前提是你有模式种的信息，因为现在属你是知道的，种的信息可以查到，但是形态鉴定太玄学，新手搞不定。还有一个简单方法就是在测几个基因 比如 acting， EF， RPP2 这些在比对 总会有差异，哪个基因能区分好就用哪个基因啰，建树时候也可以联合几个基因建树，增加区分度。
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3楼2018-04-27 20:03:12
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在水壹方

新虫 (小有名气)
二代测序只能鉴定到属，做三代测序可以鉴定到种

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4楼2018-04-27 20:49:51
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放开我baby

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 放开我baby at 2018-04-27 17:07:54
各位大神求帮忙啊

请问这几个基因是什么基因呢？怎么获得它们的引物信息啊？我对这方面是不太懂

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5楼2018-04-27 21:12:35
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放开我baby

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 在水壹方 at 2018-04-27 20:49:51
二代测序只能鉴定到属，做三代测序可以鉴定到种

是要测全基因组吗？

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6楼2018-04-27 21:13:55
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在水壹方

新虫 (小有名气)
不是，二代测序测ITs，只是扩增它的一段区域，三代测序是把它测通

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7楼2018-04-28 00:35:18
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