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Vasily

新虫 (初入文坛)


已领完
菌种鉴定结果不一致的问题
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求大神解答疑问:
同一个细菌,第一次16s方法测序出来是革兰氏阴性菌,甘油管冻存2~3年后第二次用同样方法测序居然是革兰氏阳性芽孢杆菌。
        关键我们第二次做是用G-性菌提取基因组的方法,按理是提不出G+性菌的,所以不太像试验污染的问题。
        这样情况出现很多次了,都是测序结果由G-性菌变成芽孢,请大神帮忙解惑!

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Vasily

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
1楼: Originally posted by Vasily at 2018-04-27 16:51:00
求大神解答疑问:
同一个细菌,第一次16s方法测序出来是革兰氏阴性菌,甘油管冻存2~3年后第二次用同样方法测序居然是革兰氏阳性芽孢杆菌。
        关键我们第二次做是用G-性菌提取基因组的方法,按理是提不出G+性菌 ...

请帮助解答  领了金币的兄弟姐妹

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8楼2018-04-27 16:53:23
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zyfskj

新虫 (著名写手)


向我乞求怜悯吧,我会狠狠拒绝的。
9楼2018-04-27 16:53:35
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
16s本来就不准确,你看看测序结果,DNA序列比对下,是不是差异不大,多半是你用了通用引物导致的

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10楼2018-04-28 18:22:50
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zaj123

禁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

11楼2019-05-31 08:00:56
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
提取革兰氏阴性菌基因组的试剂盒完全可以用到革兰氏阳性细菌上,我们曾经用阴性试剂盒提过枯草芽孢杆菌的基因组,也是可以的,之所以测到了,有可能你保存的种子不纯
···
12楼2019-05-31 09:39:30
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New soul2楼
2018-04-27 16:51   回复  
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2018-04-27 16:51   回复  
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pandongzi4楼
2018-04-27 16:51   回复  
Vasily(金币+2): 谢谢参与
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yyrallen5楼
2018-04-27 16:51   回复  
Vasily(金币+1): 谢谢参与
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2018-04-27 16:52   回复  
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zyfskj7楼
2018-04-27 16:52   回复  
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