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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 菌种鉴定结果不一致的问题
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Vasily

新虫 (初入文坛)
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菌种鉴定结果不一致的问题
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求大神解答疑问:
同一个细菌，第一次16s方法测序出来是革兰氏阴性菌，甘油管冻存2~3年后第二次用同样方法测序居然是革兰氏阳性芽孢杆菌。
        关键我们第二次做是用G-性菌提取基因组的方法，按理是提不出G+性菌的，所以不太像试验污染的问题。
        这样情况出现很多次了，都是测序结果由G-性菌变成芽孢，请大神帮忙解惑！

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1楼 2018-04-27 16:51:00
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Vasily

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
1楼: Originally posted by Vasily at 2018-04-27 16:51:00
求大神解答疑问:
同一个细菌，第一次16s方法测序出来是革兰氏阴性菌，甘油管冻存2~3年后第二次用同样方法测序居然是革兰氏阳性芽孢杆菌。
        关键我们第二次做是用G-性菌提取基因组的方法，按理是提不出G+性菌 ...

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8楼2018-04-27 16:53:23
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zyfskj

新虫 (著名写手)
还能这么神奇？

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9楼2018-04-27 16:53:35
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
16s本来就不准确，你看看测序结果，DNA序列比对下，是不是差异不大，多半是你用了通用引物导致的

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10楼2018-04-28 18:22:50
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zaj123

禁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
11楼2019-05-31 08:00:56
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小冀-

版主 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
提取革兰氏阴性菌基因组的试剂盒完全可以用到革兰氏阳性细菌上，我们曾经用阴性试剂盒提过枯草芽孢杆菌的基因组，也是可以的，之所以测到了，有可能你保存的种子不纯
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12楼2019-05-31 09:39:30
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New soul2楼
2018-04-27 16:51   回复  
Vasily(金币+2): 谢谢参与
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hdchina20103楼
2018-04-27 16:51   回复  
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pandongzi4楼
2018-04-27 16:51   回复  
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yyrallen5楼
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理智与情感庚6楼
2018-04-27 16:52   回复  
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zyfskj7楼
2018-04-27 16:52   回复  
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