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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】请高手们解决个问题
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liyiming9380

银虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】请高手们解决个问题

我下载的dpdmacs程序在解压缩后安装时，运行完configure还正常，再用make就出现了错误，请高手指教
软件下载地址是
http://www.mdbbs.org/thread-2594-1-1.html

[ Last edited by mingdong on 2009-3-21 at 12:36 ]
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1楼 2009-03-20 14:22:21
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liyiming9380

银虫 (初入文坛)
还有，你能不能具体的说下怎么安装flex这个东东
偶是新手，好多只是入门而已
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9楼2009-03-21 09:21:07
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tjpm

金虫 (正式写手)
你能不能给出错误提示
神也不知道你现在是怎么出问题了

每个人系统版本，内核版本，glic以及安装的其他库都不一样
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2楼2009-03-20 14:30:37
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liyiming9380

银虫 (初入文坛)
下面就是我输上make以后的代码

[yh@localhost dpdmacs]$ make
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3楼2009-03-20 14:41:09
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liyiming9380

银虫 (初入文坛)
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o gromacsio.o gromacsio.c                                                                           
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o coordinates.o coordinates.c                                                                       
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o trrio.o trrio.c   
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o shuffle.o shuffle.c                                                                              
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o dpdmacs.o dpdmacs.c                                                                              
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o commandline.o commandline.c                                                                       
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o forcefield.o forcefield.c                                                                        
forcefield.c: 在函数‘setInverseMass’中:                                         
forcefield.c:495: 警告：传递‘_mm_stream_ps’的第 1 个参数时在不兼容的指针类型间转换                                                                              
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o fillparticles.o fillparticles.c                                                                  
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o simulation.o simulation.c                                                                        
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o force.o force.c   
force.c: 在函数‘computeForces’中:                                               
force.c:40: 警告：传递‘_mm_stream_ps’的第 1 个参数时在不兼容的指针类型间转换   
force.c: 在函数‘dumpForces’中:                                                  
force.c:61: 警告：隐式声明与内建函数‘printf’不兼容                              
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o time.o time.c     
time.c: 在函数‘printProgress’中:                                                
time.c:95: 警告：隐式声明与内建函数‘strcpy’不兼容                              
time.c:96: 警告：隐式声明与内建函数‘strlen’不兼容                              
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o mdstep.o mdstep.c
In file included from mdstep.c:24:                                             
mdstep.c: 在函数‘oneMDstepXY’中:                                                
mdstep.c:110: 警告：传递‘_mm_stream_ps’的第 1 个参数时在不兼容的指针类型间转换  
mdstep.c:353: 警告：传递‘_mm_stream_ps’的第 1 个参数时在不兼容的指针类型间转换  
In file included from mdstep.c:29:                                             
mdstep.c: 在函数‘oneMDstepNON’中:                                               
mdstep.c:110: 警告：传递‘_mm_stream_ps’的第 1 个参数时在不兼容的指针类型间转换  
mdstep.c:353: 警告：传递‘_mm_stream_ps’的第 1 个参数时在不兼容的指针类型间转换  
mdstep.c: 在函数‘oneMDstep’中:                                                  
mdstep.c:110: 警告：传递‘_mm_stream_ps’的第 1 个参数时在不兼容的指针类型间转换  
mdstep.c:353: 警告：传递‘_mm_stream_ps’的第 1 个参数时在不兼容的指针类型间转换  
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o lengthscales.o lengthscales.c                                                                     
lengthscales.c: 在函数‘dumpLengthScales’中:                                    
lengthscales.c:207: 警告：隐式声明与内建函数‘printf’不兼容                     
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o newboxes.o newboxes.c                                                                             
newboxes.c: 在函数‘dumpParticleList’中:                                         
newboxes.c:445: 警告：隐式声明与内建函数‘printf’不兼容                          
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o tprio.o tprio.c   
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o innersame.o innersame.c                                                                           
gcc -DPACKAGE_NAME=\"DPDMACS\" -DPACKAGE_TARNAME=\"dpdmacs\" -DPACKAGE_VERSION=\"0.9.0\" -DPACKAGE_STRING=\"DPDMACS\ 0.9.0\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"patra@lorentz.leidenuniv.nl\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_XMMINTRIN_H=1 -DHAVE_EMMINTRIN_H=1 -DNEED_PRINT_PS=1 -DHAVE_LIBM=1  -O3 -msse -msse2 -c -o testsame.o testsame.c
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4楼2009-03-20 14:43:06
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