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Bh1993

新虫 (初入文坛)

[求助] 分子动力学模拟软件MS有困惑!!希望大家帮我解决一下!!谢谢大家 不胜感激!! 已有1人参与

大家好!对于分子动力学模拟软件MS。现在有几点不明白的,希望大家能解答一下。
1、文献中说水分子模型用TIP4P,这个怎么弄呢。是不是对着每个原子修改成TIP4P的电荷。然后我看电荷发现Ms中水分子用的是SPC模型。我这个发现是对的吗?
2、对于Forcite自定义编辑力场方面,看到可以修改D0和R0也就是井深和平衡距离,这个我看文献中都是σ和另一个势能参数。请问她们和井深之间有关系吗,若是没有 在哪里修改σ勒?
希望给与解答,谢谢谢谢 不胜感激!
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郭同学

金虫 (著名写手)

楼主解决了没?我也在考虑这个问题,有了些眉目

发自小木虫Android客户端
2楼2018-06-05 11:02:17
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流颐①

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 郭同学 at 2018-06-05 11:02:17
楼主解决了没?我也在考虑这个问题,有了些眉目

您有解决力场编辑问题,求指教呀qq775063807,谢谢
http://emuch.net/bbs/index.php?friend=2321705
3楼2018-06-29 11:17:27
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Bh1993

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 郭同学 at 2018-06-05 11:02:17
楼主解决了没?我也在考虑这个问题,有了些眉目

没解决 不大懂力场编辑 就只知道在哪里修改
4楼2018-09-17 16:23:13
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郭同学

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

知道在哪里修改就基本上已经学会了力场编辑,至少小分子是这样的,只是涉及到单位的转化问题

发自小木虫Android客户端
5楼2018-09-18 08:05:03
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郭同学

金虫 (著名写手)

过段时间我会出一个公众号,讲讲这个问题

发自小木虫Android客户端
6楼2018-09-18 08:05:32
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sunrider

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

7楼2019-09-12 11:10:18
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15930258036

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 郭同学 at 2018-09-18 08:05:32
过段时间我会出一个公众号,讲讲这个问题

您好,您的公众号在哪呀?非常非常想学习一下

发自小木虫Android客户端
8楼2020-07-18 08:28:14
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碧海森林

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 郭同学 at 2018-09-18 08:05:32
过段时间我会出一个公众号,讲讲这个问题

请问楼主公众号出了吗?正好也对此有困惑
9楼2021-08-19 10:31:22
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B202176024

新虫 (小有名气)

你可以 用VMD构建水分子模型,特别简单
10楼2021-12-03 10:35:40
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