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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 怎么给一个蛋白结构，中间加上亚铁血红素亚基？
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小汰宝

金虫 (正式写手)

[求助] 怎么给一个蛋白结构，中间加上亚铁血红素亚基？ 已有1人参与

用swiss model模拟出了酶的结构，但它应该是个含亚铁血红素的酶，模拟出来的结构不含亚铁血红素。

我现在要做分子对接，要把亚铁血红素给它安上吧？

这个用pymol怎么弄？


另外，pymol和3D molecule viewer是什么关系，为什么每次我选择用pymol为打开方式去打开结构文件，结果开的都是3D molecule viewer?


完全小白，刚接触这些软件一周，还在努力学习中，请大佬们指教，谢谢谢谢
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1楼 2018-04-19 10:39:45
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yilanding

木虫 (著名写手)
pdb view 可以解决你的问题

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很傻
2楼2018-04-19 11:16:23
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hclwonder

新虫 (正式写手)
发给我，我可以帮你弄，给你讲还更麻烦

发自小木虫Android客户端
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3楼2018-04-19 11:42:00
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autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
把血红素的pdb空间位置坐标copy到你想放的pdb文件中
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4楼2018-04-20 09:47:46
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freekeeper

新虫 (初入文坛)
好麻烦了啊。好难 我要崩溃了自学真的好难，感觉以前老师教软件的时候都不知道珍惜
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5楼2018-04-26 19:33:40
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唯爱唯美

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by freekeeper at 2018-04-26 19:33:40
好麻烦了啊。好难 我要崩溃了自学真的好难，感觉以前老师教软件的时候都不知道珍惜

我也想知道，我这个酶是在N末端有个linker的，怎么加上啊，或者建模的时候能直接建出来么？
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6楼2018-06-10 13:02:47
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小子无名

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by hclwonder at 2018-04-19 11:42:00
发给我，我可以帮你弄，给你讲还更麻烦

您好，能帮忙画个蛋白拓扑图吗？
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陪你到可可西里去看海
7楼2018-09-20 16:45:40
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妙妙唔啦

新虫 (小有名气)
您好 请问你解决了这个问题了吗 我最近也遇到这个烦恼 想请教一下您 非常感谢

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8楼2019-04-11 20:27:06
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