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小汰宝

金虫 (正式写手)

[求助] 怎么给一个蛋白结构,中间加上亚铁血红素亚基? 已有1人参与

用swiss model模拟出了酶的结构,但它应该是个含亚铁血红素的酶,模拟出来的结构不含亚铁血红素。

我现在要做分子对接,要把亚铁血红素给它安上吧?

这个用pymol怎么弄?


另外,pymol和3D molecule viewer是什么关系,为什么每次我选择用pymol为打开方式去打开结构文件,结果开的都是3D molecule viewer?


完全小白,刚接触这些软件一周,还在努力学习中,请大佬们指教,谢谢谢谢
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yilanding

木虫 (著名写手)

pdb view 可以解决你的问题

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很傻
2楼2018-04-19 11:16:23
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hclwonder

新虫 (正式写手)

发给我,我可以帮你弄,给你讲还更麻烦

发自小木虫Android客户端
3楼2018-04-19 11:42:00
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autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把血红素的pdb空间位置坐标copy到你想放的pdb文件中
4楼2018-04-20 09:47:46
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freekeeper

新虫 (初入文坛)

好麻烦了啊。好难 我要崩溃了自学真的好难,感觉以前老师教软件的时候都不知道珍惜
5楼2018-04-26 19:33:40
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唯爱唯美

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by freekeeper at 2018-04-26 19:33:40
好麻烦了啊。好难 我要崩溃了自学真的好难,感觉以前老师教软件的时候都不知道珍惜

我也想知道,我这个酶是在N末端有个linker的,怎么加上啊,或者建模的时候能直接建出来么?
6楼2018-06-10 13:02:47
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小子无名

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hclwonder at 2018-04-19 11:42:00
发给我,我可以帮你弄,给你讲还更麻烦

您好,能帮忙画个蛋白拓扑图吗?
陪你到可可西里去看海
7楼2018-09-20 16:45:40
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妙妙唔啦

新虫 (小有名气)

您好 请问你解决了这个问题了吗 我最近也遇到这个烦恼 想请教一下您 非常感谢

发自小木虫Android客户端
8楼2019-04-11 20:27:06
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