24小时热门版块排行榜    

查看: 111  |  回复: 0
当前主题已经存档。

695

木虫 (职业作家)

[交流] 大家帮我看看这几个引物设计的怎么样,刚接触,谢谢

准备做RT(反转录)-PCR,刚接触,请过来人帮我看看,这几个引物设计的怎么样,多谢了!
1、
1CTCATAAGGCACCTCCGGTAAACCAAGCCGCCTTGCCGCTGGTAACCAAACCTCGAGCAG
         >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>                                      
   61 TGTCCATATCCGTACCCATTACCAGCATAGTCGTTCCAGTACCGGTTTCAATTCCGATTC
  121 CAGATTCAACGCCGCCATCTGTAGAGCTTGATGACTCCATAGTTGCCCCATGGGACTACC
  181 AATTCTTATTCATGTCACAACGATCGGAAACCACTCAACCTATCACCCTACGTGTTGTGG
  241 ATGGTGCAGTACCGGCCGATTTTCCGACCGGTACATACTATCTAACCGGACCTGGGATTC
  301TCTCCGACGATCACGGATCGACGGTGCATCCCTTGGACGGCCATGGATACCTAAGAGCAT
  361 TCACTTTTGATAATAATGTTACTAACAAAGTCAAATACATGGCTAAGTACATTAGAACCG
  421 AGGCTCAATTGGAGGAGCATGACCCTAAGACCAACACGTGGAAATTCACTCATAGAGGTC
  481 CATTTTCTGTGTTGAAAGGTGGGAAAAAGGTTGGGAATACTAAGGTCATGAAAAATGTGG
  541 CTAACACTAGTGTGTTGAAGTGGGGGGAGAAGCTCCTGTGTATGTGGGAAGGTGGTGAAC
  601 CATACGAGATGGAATCCGGTACATTGGATACGATCGGGCGATACAACATGATGGACGATT
  661 GTGATTTGGATGATCATGAGAACCCCGGTGATCATGATGTTTGGGATGTTGCTGCTAGCT
                                                   <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<  

OLIGO           start  len   tm     gc%    any    3'   seq
LEFT PRIMER       3   20   59.95   50.00  4.00  0.00 CATAAGGCACCTCCGGTAAA
RIGHT PRIMER    717   20   60.26   45.00  3.00  0.00 TAGCAGCAACATCCCAAACA
SEQUENCE SIZE: 741
INCLUDED REGION SIZE: 741


2、
1 GTCATTCTTTCCCTGCTACTGACCACTATGTTATTGTGCCTGAAATGCCTCTTAGATACT
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
   61 GTGCTCAGAATTTACTAAAGGCTGAGCCTACTCCACTGTACAAGTTCCAGTGGCACCCTG
  121 AATCCAAAGCTTTTATGCATGTCATGTGCAAGACTAGTGGAAAGATTGTGGCAAGTGTGG
  181 AAGTGCCTCTGTTCATCACTTTCCATTTCATAAATGCGTACGAAGAGGAAGATGAAGATG
  241 GGAGGGTGACGGCAGTTATTGCTGACTGTTGTGAGCACAATTCAAATACTGACATTCTTG
  301AAAGGCTTAGATTACAGAATCTTCGCTCATTCAATGGCCAAGATGTTCTGCCAGATGCTA
  361 AGGTTGGTCGGTTCAGAATACCTCTGGATGGGAGTCCAAATGGAACACTGGAACCAGCAT
  421TAGACCCAAATGAACATGGGAAAGGCATGGACATGTGCAGCATAAACCCTAACTATTTAG
  481 GGAAGAAATACAGATATGCCTATGCTTGTGGAGCAAACCGACCTTGTAACTTTCCCAACA
  541CCCTCACCAAGCTTGATTTAGAGTTGAAAAAGGCTAAGACCTGGTATGATGAAGGTGCTG
  601 TGCCATCTGAACCATTCTTTGTGGCTCGACCAGGAGCAACAGAGGAAGATGATGGTTAGA
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<  
  661 CTAGCTACTACATTTGAAGCCTGTTCTCTCTAATATTCAGCCCCTTCT

OLIGO      start  len    tm    gc%    any    3'   seq (5’-3’)
LEFT PRIMER    5   21  59.86  47.62  2.00  2.00 TTCTTTCCCTGCTACTGACCA
RIGHT PRIMER 655   21  59.30  47.62  3.00  0.00 CCATCATCTTCCTCTGTTGCT
SEQUENCE SIZE: 708
INCLUDED REGION SIZE: 708


3、
1 ATGGTGTTCATGGATTTTGAATGGTTGTTCCAAATTCCAAGTGTCCCTTGGTCTTCAGCA
   61 ATGTTTACCTTGCTGGCTACAATAGGAGGATTCTTAGTGTATCTGTATGGGCCCTACTGG
  121 GGTGTGAGGAAAGTTCCAGGTCCACCATCTGTGCCTCTGATAGGACACCTTCCCTTGCTG
  181 GCTAAGTATGGCCCTGATGTCTTTTCAGTCCTTGCCAAGCAATATGGCCCAATCTACAGA
  241 TTTCATATGGGAAGACAACCTCTAATAATCATAGCAGATGCAGAGCTTTGCAAAGAGGCA
  301 GGCATCAAAAAATTTAAAGACATTACAAACAGAAGCATTCCCTCTCCCATTTCTGCATCC
  361 CCCCTTCACCAAAAGGGTCTCTTCTTCACCAAAGATTCACAATGGTCTACCATGAGAAAC
  421 ACCATATTATCACTCTACCAGCCATCACACTTATCCAGATTAGTGCCAACAATGCAGTCA
  481 TTTATAGAATCAGCAACTCAAAATCTAGATTCTCAAAATGAAGACTTCATCTTTTCTAAT
  541 CTTTCGCTCAGCTTGGCAACTGATGTGATTGGACAAGCAGCATTTGGTGTTGATTTTGGC
  601 CTCTCGAGGCCTCAATCAGTGCGTGATGAAAGTGGCAACAAGGAAGTAAGGGGTTCAGGT
  661 GCTGGTAATGAAGTATCAGATTTCATTAACCAACACATTTACTCCACAACCCAACTCAAG
  721 ATGGACCTATCTGGTTCCTTCTCCATCATACTGGGTTTACTTGTCCCAATTCTCCAGGAG
  781 CCATTTAGGCAGATTCTGAAGAGAATTCCAGGCACCATGGACTGGAAAATCGAGTGTACT
  841 AACCGAAAACTAAGTGGCCGTCTTGATGAAATTGTAGAGAAGAGAATGAAGGATAAGGTC
  901 AGAAGTTCCAAGGACTTCTTGTCACTCATTCTAAATGCAAGAGAATCAAAAACTGTTTCA
  961 GAAAATGTGTTCACACCTGACTATATCAGTGCTGTTACTTATGAGCACCTGCTTGCAGGA
1021TCAGCAACCACATCCTTTACCTTGTCTTCCATTGTCTATTTGGTTGCTGGGCATCCAGAA
  1081 GTTGAGAAAAAGATGCTTCAAGAGATTGATGGGTTTGGCCCAGTAGATCAGACACCAACT
1141 TCTCAAGATCTTCAAGAGAAGTTTCCTTACCTTGATCAGGTGATCAAAGAGGCCATGAGA
  1201 TATTACACAGTCTCTCCATTGGTTGCAAGAGAAACATCAAATGAAGTAGAGATTGGAGGT
  1261 TACCTTCTTCCAAAGGGGACTTGGGTCTGGTTAGCGCTTGGAGTTGTAGCAAAAGATCCC
1321 AGAAACTTTCCGGAGCCAGAAAAGTTCAAACCGGAGAGGTTTGATCCCAAATGTGAAGAA
1381 ATGAAAAGAAGACATCCTTATGCTTTCATACCATTTGGAATTGGTCCTCGGGCTTGCATT
1441 GGTCAGAAATTTTCCCTGCAAGAAATCAAGCTGTCTCTGATTCACTTATATAGGAAATAC
1501 TTGTTTCGGCATTCACCTAATATGGAGAATCCCTTAGAACTTGAATATGGCATAGTGCTC
1561 AACTTCAAGCACGGTGTCAAGGTTAGAGCCATAAAAAGAACAGAGAGGAGCTGCTAA

OLIGO       start  len   tm    gc%   any      3'  seq(5’-3’)
LEFT PRIMER  132   20   59.96   55.00  4.00  2.00 AGTTCCAGGTCCACCATCTG
RIGHT PRIMER1578  20   59.88   50.00  5.00  3.00 GACACCGTGCTTGAAGTTGA
SEQUENCE SIZE: 1617
INCLUDED REGION SIZE: 1617

4、
1 ATGAGTAACGCTGCTGAAACCACCGTCAGGCACTTGCCGGAGGAGATCCTGTTGAAGGTG
   61 TTCTCCGGGGTTAGTGATACCCGGACGCGGAACTCGCTCTCGCTTGTTTGCCGGAGCTTC
  121TACTGCTTCGAGCGCAGGACGCGCTCCTCCCTCACGCTCCGGGGAATCGCGCGTGACCTC
  181 TACTTGATCCCGACCTGCTTCGCGCACGTCACGCACCTCGACTTGTCGCTCCTCTCGCCG
  241 TGGGGCCACGCGCTGCTCTGCTCGTCCTCCACCGCCGACCCTCACCACCTTGCCCAACGC
  301CTCCGCGACGCCTTCCCGCGCGTGACCTCGCTCGTCGTCTACGCGCGCGAACCGACCACG
  361 CTCCACCTTCTCCTGCTCTCTCCCTGGCCGGAGCTCCGCCATGTTCGCCTTGTCCGATGG
  421 CACCAGCGCCCGCCGTCGTCGCCAGCTGGATCTGACTTCGCGACTTTGTTCTCGCGCTGC
  481 CGATCGCTCACCTCGCTGGATCTCTCCGCCTTCTACCACTGGCCGGAGGATCTCCCGCCT
  541 GTCCTGACAGCGAACCCCGCCGCCGCCGCATCTCTACGGCGGCTGAACCTCCTAAAGACG
  601 TCGTTCACGGAGGGCTTCAAGTCTCACGAAATCGAATCCATCACCGCATCTTGCCCTAAC
  661 CTGGAGCACTTTCTCGTGGCCTGCACTTTCGATCCGAGATACATAGGGTTCGTCGGTGAC
  721 GAGACGCTGTCGGCGATCCCTTCCAATTGCCCCAAGCTCTCGCTCCTTCACCTTGCTGAT
  781 ACGTCATCGTTTTCGAACCGGAGCGACGATGACGGTAACGGCGGGGAGGACGCGAGGATT
  841 AGCCACGAGACGCTGGTGGCGTTGTTCTCCGGGCTTCCCCTTTTGGAAGAGCTGGTGCTA
  901 GATGTTTGTAAAAATGTCAGAGAGAGTAGTTTTGCTATGGAGGTTTTGAGTAAGAAGTGT
  961 CCCAATTTGAGGGTTCTCAGGTTGGGTCAGTTTCAGGGGATTTGCTTGGCCATTGGGTCA
1021 AAGCTCGATGGAATTGCCCTTTGCCAAGGGCTTCGATCCTTGTCCATTCATGGCTGTGCG
1081 GACCTCGATGACATGGGGTTGATTGAGATTGCAAGAGGTTGTTCCAGGTTGGTTCAGTTT
1141 GAGCTTCAGGGCTGCAAGCTTGTCACGGAGAAAGGGTTGGGGACCATGGCTTGCTTGCTT
1201 CGTAAGACTCTTGTGGATGTCAAGGTTTCTTGCTGTGTCAATCTCGACACCGCGGCGGCA
1261 CTCAGAGCTCTGGACCCTATCCGGGACCGGATTGAGCGGCTTCATGTGGATTGCGTGTGG
1321 AATGGCTTGAAGGACAGTGATGACAACATGGGAGGTGGTCTTCTCAATTTTGACCTGAAT
1381 GACCCCAATGGTGGTGCTGAAATCATGGATTGCTTTGGGGATGAGGAATGTGAAGACCCA
1441 AGCAAAAGGAAGAGGCAGAGATGCGAGTATGGACTAGAGGGTGATGATTCCTTGGTGCAA
1501 AGCAATGGCAATGGTTACTATGGCAAGAACTGGGACAGGCTGCGTTATCTCTCTCTTTGG
1561 ATAAAGGTTGGTGATCTTCTGAATCTCTTACCGGTGGCAGGGTTGGAGGATTGCCCTAAC
1621 CTGGAAGAGATTCGTGTGAAGGTTGAAGGAGATTGCAGGGGGCAGCCAAAACCAGCTGAG
1681 AGTGAATTTGGTCTCAGCATCCTGGCTTGTTATCCACAGCTATCAAAGATGCAGCTGGAT
1741 TGTGGTGATACAAGAGGCTATGTGCTCACAGCGCCTTCAGGGCAGATGGATCTGAGCTTG
1801 TGGGAGAGGTTTTTTCTCAATGGGATTAGTAGTTTGAGTCTGAATGAGCTTCATTACTGG
1861 CCACCACAAGATGAGGACGTAAACCTGAGGAGTGTTTCACTTCCAGCTGCCGGCTTACTT
1921 CAAGAATGTTACACCCTGAGGAAGCTTATCATTCATGGGACAGCTCATGAACATTTCATG
1981 AATTTTTTCCTCAAGATCCCAAACCTGAGGGATGTGCAGCTGCGAGAGGATTATTATCCA
2041 GCACCGGCAAGTGACATGAGCACGGAGATCAGGGTGGGTTCATGCAGCCGCTTTGAAGAT
2101 GCATTAAACAGGCGTCATATCTGTGATTGA

OLIGO            start  len      tm     gc%   any    3' seq
LEFT PRIMER106   20  60.02  55.00 4.00 1.00 GTTTGCCGGAGCTTCTACTG
RIGHT PRIMER1810 20  59.99  55.00 4.00 3.00 ACCTCTCCCACAAGCTCAGA
SEQUENCE SIZE: 2130
INCLUDED REGION SIZE: 2130
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 695 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见