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happy_rolly

新虫 (初入文坛)

[求助] 用matlab求动力学参数代码 求指教已有1人参与

附件中的文章  跟我的研究方向比较相关  所以想重现一下作者的结果,

首先建立传染病动力学SEIQR模型(分别表示易感者、潜伏期、感染未住院、感染并住院、康复),然后写出了模型的常微分方程组,共有8个参数,能给出数值的有μ和δ,另外六个参数给出了初始值范围,并且需要估计
S E I Q R五个未知数中,S Q R的初始值可以给出,E I是给定范围 ,要估计
最优参数的估计采用的是fminsearch,目标函数是MSS=(log2 (1+data per month) 2-log2 (1+ infectious and hospitalized on day 1+...+on day 28(or 29,30,31)))2

目标函数表达式中data per month就是表1中  每月发病人数/10,   另外 infectious and hospitalized on day 1+...+on day 28(or 29,30,31)应该是来源于常微分方程组的解
目前为止我只写出了常微分方程组的代码,见li.m  至于如何构建MSS这样的目标函数,以及如何利用常微分方程组的解和每月发病数据来求MSS最小值 并且要得出另外六个参数值和E I的初始值 我一点头绪也没有  
求大神指教 必有重谢 最好能给出matlab代码   医学生学matlab好困难,整个课题组就我一个人在做这个

*li.m
function f=li(t,y)
u=3.9139*10^-5;
f=[u*(y(1)+y(2)+y(3)+y(4)+y(5))-b*(y(3)+y(4))*y(1)/(y(1)+y(2)+y(3)+y(4)+y(5))+r*y(5)-u*y(1);
    b*(y(3)+y(4))*y(1)/(y(1)+y(2)+y(3)+y(4)+y(5))-a*y(2)-u*y(2);
    a*(1-p)*y(2)-m*y(3)-u*y(3);
    a*p*y(2)-n*y(4)-u*y(4);
    m*y(3)+n*y(4)-r*y(5)-u*y(5)];
用matlab求动力学参数代码  求指教
常微分方程组.png


用matlab求动力学参数代码  求指教-1
表1 每月发病数据.png
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  • 附件 1 : Li-2014-Modeling_and_Prevent.pdf
  • 2018-04-18 23:20:19, 315.08 K

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常微分方程

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dingd

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
微分方程拟合问题自己用1stOpt试试,很简单的。
3楼2018-04-20 17:09:41
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