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做系统发育树
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上善若水白杨
金虫
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在线: 13.2小时
虫号: 8319314
注册: 2018-03-19
性别:
MM
专业: 昆虫学
[交流]
做系统发育树
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做系统发育树的时候是应该下载全序列,还是对比序列?再去MEGA上做系统发育树。谢谢各位了~
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1楼
2018-04-18 10:14:06
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castalli
新虫
(小有名气)
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金币: 8
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帖子: 297
在线: 26.8小时
虫号: 3893814
注册: 2015-05-27
专业: 免疫生物学
都行把,
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2楼
2018-04-18 14:01:42
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xp198766
铁杆木虫
(著名写手)
小木虫职业打酱油滴~~!
MolEPI: 1
应助: 5
(幼儿园)
金币: 6525.1
散金: 262
红花: 25
帖子: 2193
在线: 554小时
虫号: 1046859
注册: 2010-06-24
性别: GG
专业: 环境微生物学
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
对比上的序列,不是全序列,序列的起始和终止和你的query序列一致,然后做align,再做树
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3楼
2018-04-18 16:01:34
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BioChen
银虫
(正式写手)
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(初中生)
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红花: 7
帖子: 386
在线: 107.4小时
虫号: 3168808
注册: 2014-04-28
专业: 生物信息学
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
mRNA,cDNA,protein,domain都可以用来建树,还可以选取以上序列的部分(软件自动选,手动选)进行建树。
生物信息不容易造假,数据和方法都是公开的,但是可以调参
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4楼
2018-05-01 22:18:46
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乌拉拉2018
新虫
(初入文坛)
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(幼儿园)
金币: 16
帖子: 7
在线: 50分钟
虫号: 7986804
注册: 2018-02-09
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
先下载你需要的某个基因的序列,然后进行多重序列比对,软件会生成比对后的序列,再将这个序列直接导入mega,就可以做出图了,那个软件我忘了怎么打了,明天再找一下给你
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5楼
2018-05-08 18:00:14
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