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上善若水白杨

金虫 (小有名气)

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在线: 13.2小时
虫号: 8319314
注册: 2018-03-19
性别: MM
专业: 昆虫学

[交流] 做系统发育树已有4人参与

做系统发育树的时候是应该下载全序列，还是对比序列？再去MEGA上做系统发育树。谢谢各位了～

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热爱科研，满腔热血。

1楼 2018-04-18 10:14:06

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castalli

新虫 (小有名气)

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帖子: 297
在线: 26.8小时
虫号: 3893814
注册: 2015-05-27
专业: 免疫生物学

都行把，

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2楼2018-04-18 14:01:42

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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！

MolEPI: 1
应助: 5 (幼儿园)
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红花: 25
帖子: 2193
在线: 554小时
虫号: 1046859
注册: 2010-06-24
性别: GG
专业: 环境微生物学

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

对比上的序列，不是全序列，序列的起始和终止和你的query序列一致，然后做align，再做树

3楼2018-04-18 16:01:34

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BioChen

银虫 (正式写手)

应助: 93 (初中生)
金币: 83.8
红花: 7
帖子: 386
在线: 107.4小时
虫号: 3168808
注册: 2014-04-28
专业: 生物信息学

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

mRNA，cDNA，protein，domain都可以用来建树，还可以选取以上序列的部分（软件自动选，手动选）进行建树。
生物信息不容易造假，数据和方法都是公开的，但是可以调参

4楼2018-05-01 22:18:46

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乌拉拉2018

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 16
帖子: 7
在线: 50分钟
虫号: 7986804
注册: 2018-02-09

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

先下载你需要的某个基因的序列，然后进行多重序列比对，软件会生成比对后的序列，再将这个序列直接导入mega，就可以做出图了，那个软件我忘了怎么打了，明天再找一下给你

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5楼2018-05-08 18:00:14

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