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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » MENA做网络分析 现在还能用吗
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mimi_lala

新虫 (初入文坛)

[求助] MENA做网络分析 现在还能用吗 已有1人参与

MENA做微生物的网络分析 我用示例数据做还是500 error  试过所有浏览器 都这样 试好几天了 请问怎么回事 大家遇到这样情况了吗 还是我的操作有什么问题 有什么要注意的
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1楼 2018-04-18 08:39:53
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mimi_lala: 金币+4 2018-04-18 15:32:47
你是用的这个网址吗？http://ieg4.rccc.ou.edu/mena
我刚用还是可以用的
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2楼2018-04-18 15:13:10
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mimi_lala

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xp198766 at 2018-04-18 15:13:10
你是用的这个网址吗？http://ieg4.rccc.ou.edu/mena
我刚用还是可以用的

刚刚试了下 也能用了 同学 你知道构建网络的时候 有时候显示 your dataset met some error,eithor over our limitation(50<the gene/OTU number<2000)to run RMT modeling after removing the genes/OTUs with some missing data.  总遇到这种情况怎么回事啊  谢谢
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3楼2018-04-18 15:42:11
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！

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★ ★ ★
mimi_lala: 金币+1 2018-04-18 16:37:38
snoopytbw: 金币+2, 鼓励 2018-04-18 19:39:31
这个应该是说你的OTU数目太多，大于2000或者太少，小于50，你需要调整一下
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4楼2018-04-18 16:03:12
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mimi_lala

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by xp198766 at 2018-04-18 16:03:12
这个应该是说你的OTU数目太多，大于2000或者太少，小于50，你需要调整一下

可是我OTU才800多
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5楼2018-04-18 16:37:58
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
是不是有missing data？看一下，是不是每个OTU都有reads，另外有没有将行列弄反之类的问题
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6楼2018-04-18 16:49:10
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mimi_lala

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by xp198766 at 2018-04-18 16:49:10
是不是有missing data？看一下，是不是每个OTU都有reads，另外有没有将行列弄反之类的问题

missing data 怎么看 是什么意思 有一些是零
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7楼2018-04-18 20:49:13
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
引用回帖:
7楼: Originally posted by mimi_lala at 2018-04-18 20:49:13
missing data 怎么看 是什么意思 有一些是零...

有没有可能有的OTU在所有样品是全是0，另外，行列是否有错误，还有，MENA中刚开始会让你选择，在你的样品中出现率达到多少（比如在50%的样品中出现的OTU被保留）这样的数值
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8楼2018-04-19 16:46:53
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yuweina93

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by mimi_lala at 2018-04-18 15:42:11
刚刚试了下 也能用了 同学 你知道构建网络的时候 有时候显示 your dataset met some error,eithor over our limitation(50&lt;the gene/OTU number&lt;2000)to run RMT modeling after removing the genes ...

我也每次都显示500error，请问这要怎么解决？
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9楼2018-05-08 13:54:29
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yigeli

金虫 (正式写手)
内容已删除
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tobebetter
10楼2018-05-11 10:29:55
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