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xudingwen

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请问高斯里怎样计算同一个分子的不同构象的能量呢

如题,我将一个分子的最低能量构象用于做分子对接后获得一个药效构象,请问怎样计算这两个构象之间的能量差呢?

[ Last edited by xuefei06 on 2009-3-19 at 14:53 ]
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loovfnd

至尊木虫 (著名写手)


xuefei06(金币+1,VIP+0):3Q! 3-19 14:53
用这两个几何算出能量,然后想减不行吗?
没太看明白楼主的一丝丝。呵呵
莫强求!
2楼2009-03-18 22:49:36
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xudingwen

铁虫 (小有名气)

那请问怎样在高斯里面算能量呢?对不起 ,我是个高斯小菜鸟
3楼2009-03-19 09:00:31
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S07111072

铁杆木虫 (著名写手)


xuefei06(金币+1,VIP+0):3Q! 3-19 14:53
直接opt构型优化就可以了
4楼2009-03-19 11:45:17
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 3-20 09:42
用高斯分别优化两个不同构象,计算单点能(推荐DFT的方法),然后把计算得到的两个能量相减就得到你要的能量差。
5楼2009-03-20 07:57:49
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nyzhaoyin

新虫 (正式写手)


jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论! 3-20 20:21
引用回帖:
Originally posted by xudingwen at 2009-3-19 09:00:
那请问怎样在高斯里面算能量呢?对不起 ,我是个高斯小菜鸟

  直接优化  里面就有能量值  建议看一下高斯输出文件各个部分代表什么(坛子里有  搜索一下)
6楼2009-03-20 14:11:58
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