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lyli2017

新虫 (小有名气)

[交流] VASP跑分子动力学,小体系能跑,大体系作业会掉,求大腿帮忙~~

KPOINTS用gamma或者不是gamma都一样。
INCAR一样的,就只能在2x2的表面跑,4x4的作业跑一步自动掉。求问解决方案,谢谢了~
体系是有机小分子覆盖在金属表面。
寻求能量最低点,想试试。
作业说killed by signal 9
请问是内存问题还是?请问怎么解决呢?
GGA = PE?????????????????? ?
?? POTIM = 2???????????????? ?????????????????
?? NPAR?? = 1
?? LPLANE = .TRUE.
------------------------------------------
Electronic Relaxation:
-----------------------------------------
?? LREAL? = Auto???????????? ?????????????????????
?? ENCUT? = 400
?? PREC?? = Normal????
?? EDIFF? = 1e-5?????????????
?? IALGO? = 48????????????
?? NELM=? 70?????????????????
?? NELMIN = 4???????????????? ?
?? ISIF?? = 0?????????????
?? ISPIN? = 2???????????????????
-------------------------------------------
Ionic Relaxation:
-------------------------------------------
?? EDIFFG =-0.03????????????
?? NSW??? = 5000????????????
?? IBRION = 0
--------------------------------------------
DOS Related:
--------------------------------------------
?? ISMEAR = 1
?? SIGMA? = 0.2
? ?LORBIT =11
--------------------------------------------??
Output Control:???????????????????????????????
--------------------------------------------??
?? LWAVE? = .FALSE.
?? LCHARG = .FALSE.
--------------------------------------------
NBLOCK = 1
KBLOCK = 50
TEBEG=300 ?
TEEND=300 ?
NWRITE = 0
MAXMIX = 40
SMASS = 3

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lyli2017

新虫 (小有名气)

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引用回帖:
16楼: Originally posted by only_大师 at 2018-04-07 08:51:28
potim咋设置这么大。。。一般初次优化结构都是0.5,精优可能是0.1充分优化不应该是isif=3么?你们是自己的单个服务器还是服务器群?是几个节点几个核?npar的设置跟这个有关系。另外如果体系原子很多,根据经验kpo ...



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17楼2018-04-07 11:47:39
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lyli2017

新虫 (小有名气)

送红花一朵
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16楼: Originally posted by only_大师 at 2018-04-07 08:51:28
potim咋设置这么大。。。一般初次优化结构都是0.5,精优可能是0.1充分优化不应该是isif=3么?你们是自己的单个服务器还是服务器群?是几个节点几个核?npar的设置跟这个有关系。另外如果体系原子很多,根据经验kpo ...

其实关键是作业会掉。。都提交不上去。。。精度什么的都暂时不管了。。。。。小体系就能提交,大体系就掉。。。一模一样的INCAR和KPOINTS。。。。。POSCAR格式也都一样。。POTCAR绝对没问题。。

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18楼2018-04-07 11:49:52
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lyli2017

新虫 (小有名气)

送红花一朵
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16楼: Originally posted by only_大师 at 2018-04-07 08:51:28
potim咋设置这么大。。。一般初次优化结构都是0.5,精优可能是0.1充分优化不应该是isif=3么?你们是自己的单个服务器还是服务器群?是几个节点几个核?npar的设置跟这个有关系。另外如果体系原子很多,根据经验kpo ...

正确与否暂时不管了。。。只求不从服务器掉下来。。。

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19楼2018-04-07 11:51:02
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lyli2017

新虫 (小有名气)

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16楼: Originally posted by only_大师 at 2018-04-07 08:51:28
potim咋设置这么大。。。一般初次优化结构都是0.5,精优可能是0.1充分优化不应该是isif=3么?你们是自己的单个服务器还是服务器群?是几个节点几个核?npar的设置跟这个有关系。另外如果体系原子很多,根据经验kpo ...

一个节点,16个核。换两个节点也不行。。   gg,KPOINTS和INCAR改过很多种。。。貌似回复了很多条信息。。打扰了

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20楼2018-04-07 11:53:59
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lyli2017

新虫 (小有名气)

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21楼: Originally posted by only_大师 at 2018-04-07 23:01:47
16个核你就别想了。。。果断kpoints调小,别的都不好使
...

不对。。貌似是一个核,16个节点。。

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22楼2018-04-07 23:08:25
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lyli2017

新虫 (小有名气)

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23楼: Originally posted by only_大师 at 2018-04-08 00:51:52
大兄弟,手机都不止一个核。。一个是节点,16个是核。别想了,16个核算200个原子以上的就会吃力了,kpoints最好跟你的超胞结构匹配,比如你的超胞是2×2×1,你的k点也最好设成这个,不然很容易停
...

谢谢指导。。

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24楼2018-04-08 07:33:03
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