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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 未知目的蛋白的序列，如何设计引物
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妖十二

新虫 (初入文坛)

[求助] 未知目的蛋白的序列，如何设计引物 已有1人参与

目的蛋白序列未知，需要进行同源性比对找到保守序列。如何进行比对？如何找到保守序列？找到同源物种的两个保守序列段，如何选择自己所需要的保守序列？如何将选择的保守序列与自己研究的目的蛋白联系起来（也就是说，拿到保守序列接下来应该做什么）？纯新手，求大神帮忙解决一下

@biostar2009 @飞约疯人院 @wizardfan @youlinglyw 发自小木虫Android客户端
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1楼 2018-04-04 20:01:27
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渊博震天
顶一下

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2楼2018-04-04 23:22:23
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drwhoknowss

荣誉版主 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个问题好像是90年代的克隆做法，现在基本都有基因组了，很少用了。
我记得当年上课时讲过，拿到保守序列后你要反翻译，成DNA序列，然后设计degenerate primer，去扩增。然后通过5RACE和3RACE找全长。
细节真不知道，祝好运
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Progress in science depends on new techniques, new discoveries and new ideas, probably in that order. -- Nobel laureate Sydney Brenner
3楼2018-04-04 23:47:28
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