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关于ms中分子动力学模拟时换系综restart的问题?
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大家好!! 请教大家一个问题! 我们在做分子动力学模拟时,比如要让体系达到25mpa、700k,那么我们应该是先用npt系综使系统达到平衡。接着计算性质时,我看到有时需要换其他系综统计性质,但是这里有一个问题出现了。换系综我们应该是要接着计算对吧,就是要点击“restart”那个按键,但无论换哪个系综,比如NVE吧,那么这个固定的V就是之前npt结束前最后一步的V,因为在npt中V是在平均值附近波动的,所以我们按照NVE计算无论V还是E其实都已经和平衡状态不同了(平均值是一样的,但我们计算时用的是固定值)。 所以我的想法是会不会统计性质时不能换系综呀?或者是我的理解错了,不是这样计算的?还是有什么其他原因呢 谢谢大家帮忙讨论!! |
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