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永远的晴天

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因表达分析

1楼
实验室完成了抗感品种接菌后的转录组测序，例如某一时间点3个重复的fpkm值相差较大，该以什么来作为该基因这一时间点的表达量？是不是单纯的取3次重复的平均值？

   ID               CK1-fpkm     CK2-fpkm       CK3-fpkm

XXXXXX            142                 86                  118
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1楼 2018-03-25 14:16:48
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suyouzhen

铁杆木虫 (小有名气)
RPKM/FPKM归一化的方法已经淘汰了，可以参考TPM或其他方法。

发自小木虫Android客户端
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2楼2018-03-26 13:46:27
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