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fyqfyh82木虫 (小有名气)
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【求助】MS4.0手动设置力场～
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想请教手动设置力场的问题，我下载了一个文档，《MS 4.0中可以手动设置力场.txt》，但还有两个问题不明白： 1.原文最后的问题没有解答； 2.我打开.off文件，对其中的一些参数选择不理解，比如dreiding里的 “SHRINK_CH_BONDS F”； “ H-BOND_METHOD SPLINE”等等，请对这些有了解的朋友帮忙解释！非常感谢！ 原文是这样的， “ MS 4.0中可以手动设置力场嘛 ？ 我想在MS的力场文件中添加新的原子类型，及其参数；以便使用discover和forcite进行MD 模拟，但是不知道如何下手。 类似于cerius中的OFF,有没有？ forcite模块就是off模块 ZHU: 请问在MS中模拟时,怎么查看自己的体系用了力场参数是什么?因为文献中都有列出自己体系的力场参数,我从来都不知道自己体系的力场参数是什么. MS的很多力场文件是可读的，比如以.off为扩展名的力场文件，除了compass.off都是可以读的，也可以修改； 通过查文献获取特殊的参数进行修改； 当然你也可以自己拟合力场参数了。 简单的办法，你直接搜索.off OFF文件使用时，如何让它出现在forcite->energy->forcefields的选择单内呢？ 多谢！ 你可以将原来力场文件，比如xxx.off备份成~xxx.off,然后，在xxx.off的基础上增加你的参数或修改其中参数。这样是肯定会被识别的 .off修改了之后,.frc, templates文件是不是也要对应的修改才会被识别呢？ forcite 读入的是.off还是.frc呢？ 不胜感激！ forcite读入的是.off模块， 符合原文件格式，都是可以进行内部参数修改 看了.off后，发现里面没有电荷数的数据，这是怎么回事呢？如果新加入的原子类型 具有电荷数，应该怎么设置呢？ 另外，新加入的原子类型，在计算时怎么归属给模型中的原子呢？也就是说，怎么让模型中的原子具有想给它的参数呢？ |
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