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qli0218

木虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】布局数分析

我现在再用Dmol的过渡态搜索,现在我在试图解释催化反应的反应过程,但是有那么多的布局数,而且把反应过程的布局数都列出了好大的一张表,分析得我实在头痛……
读了一个资料说
“态密度对成键的定量化描述不是很强,所以我们往往要进行布居分析,原子布居和键布居,根据布居的数值来判定成键的强弱。”
可是怎么通过布局数分析成键的强弱或所成键的性质呢?键布局怎么能看到呢?
在out文件里有密歇根电荷分析,和布局分析好像有些相似,但是也不太会用,所以就把他放一边了,只看布局数。
对于成键现在还不知道能不能分析,用过vasp里面见过键的能量,但是原子一多就不知道哪个是哪个了……MS能不能体现出来呢?

希望各位大侠一起讨论……
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yzcluster

金虫 (著名写手)

小木虫扫盲人

★
qasd(金币+1,VIP+0):xiexie 3-16 18:20
可以用MAYER BOND ORDER来试试看
2楼2009-03-16 11:48:03
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)

★ ★ ★ ★
qasd(金币+2,VIP+0):xiexie 3-16 18:20
qli0218(金币+2,VIP+0):非常感谢,希望继续讨论 3-17 13:47
Overlap populations重叠布居,相当于键级的概念 ,一般来说,正值表示成共价键,正值越大,共价性越强,0表示纯离子键。负值表示反键。不同的赝势、泛函计算的结果可能有差别.
bond population 计算得到的结果除了有atomic population以外还有就是bond population 也可以叫overlap population
储氢家族欢迎储氢研究者!
3楼2009-03-16 18:05:10
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qli0218

木虫 (小有名气)

问问楼上……

bond population 计算和Overlap populations重叠布居在out文件里都有么?
相当于键级的概念:和Mayer Bond order一样么?在out里有Mayer Bond orders和Mulliken bond orders,但是没有bond population 啊……这两个我还用的不熟,不知道怎么和间的能量联系上,而且布局数也没有找到……
4楼2009-03-17 14:53:03
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)

★ ★ ★
wuli8(金币+1,VIP+0):谢谢! 3-17 20:40
qli0218(金币+2,VIP+0):谢谢 3-19 07:20
不同软件布居计算方法不一样,
这个没关系,因为 只要同方法同基组计算的populations比较还是有意义的,

用 populations搜索就可以找到想要的结果。
储氢家族欢迎储氢研究者!
5楼2009-03-17 18:33:38
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qli0218

木虫 (小有名气)

我用Bond_order on计算出了的布局数是个个原子的各个轨道的布局数,而且有的是两行,一行的值比较大,而另一行则较小,所以考虑可能是误差。但是还没有看出哪个是键的布局数,是不是还有什么命令阿?
6楼2009-03-19 07:24:20
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