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hgkjqx

铜虫 (小有名气)

[求助] castep做吸附时,吸附初始构型怎么建 已有1人参与

比如一种矿物吸附水分子,矿物表面切割出来建立2x2的表面超晶胞后进行表面弛豫,在另一个xsd文件中新建水分子,将其放入20x20x20的晶胞中进行结构优化,然后该怎么办?如何将水分子放置到矿物表面?tutorial中CO吸附在Pd上面的例子是根据键长,不知道键长的情况下如何放置?
如何确定放置的位置就是顶位,桥位或穴位?
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hgkjqx

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by honeyrun at 2018-06-25 17:51:30
您好,我也是刚学MS,请问20x20x20的晶胞是怎么建立,就是矿物的晶胞吗

supetcell里面设置20*20*20

发自小木虫Android客户端
5楼2018-06-27 17:21:26
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查看全部 5 个回答

前田庆次

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
hgkjqx: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢指教 2018-04-06 07:38:20
比如一种矿物吸附水分子,矿物表面切割出来建立2x2的表面超晶胞后进行表面弛豫,在另一个xsd文件中新建水分子,将其放入20x20x20的晶胞中进行结构优化,然后该怎么办?如何将水分子放置到矿物表面?tutorial中CO吸附在Pd上面的例子是根据键长,不知道键长的情况下如何放置?

一般情况下,这种小分子都是物理吸附,吸附能不会很高,吸附键长也比较大,设置初始距离为2.5-3.0A,仁兄认为可好?

如何确定放置的位置就是顶位,桥位或穴位?

挨个尝试,多个构型挨个尝试

个人愚见,仅供参考
长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
2楼2018-04-05 12:46:47
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honeyrun

新虫 (初入文坛)

您好,我也是刚学MS,请问20x20x20的晶胞是怎么建立,就是矿物的晶胞吗
3楼2018-06-25 17:51:30
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飞天ssp

新虫 (职业作家)

hh
4楼2018-06-25 21:39:38
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