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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » HyperChem/NWChem » 【求助】Hyperchem中如何进行手型分子构型转化
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federche

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Hyperchem中如何进行手型分子构型转化

现在画一个分子，几个稠环并着螺环，我想进行环上手型碳的R-S构型转变。按照manual上的说明，比如按下shift+画图工具下的L-click，只能改变侧链可自由旋转的碳构型，但不能改变张力比较大的环上碳（稠环和螺环都不成）。

因此，请教各位，有办法可以解决吗？不甚感激。

[ Last edited by xuefei06 on 2009-3-15 at 23:30 ]
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1楼 2009-03-15 11:28:08
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半支烟5591

铜虫 (正式写手)

专家
★ ★
federche(金币+1,VIP+0):谢谢评价 但还是不清楚 3-15 23:48
yuhuobuku(金币+1,VIP+0):欢迎参加讨论 3-16 12:55
那你画图的时后就把RS构型弄好，四个原子序号按R或S排好，不要用加氢模型化的功能，而是可以先初步计算一下构型，基本就可以了，如果是环上的，要改变环要么开来与别的残基成新环，要么不再成环，反正关键是RS是由四个基团决定的，要改就要改他们的优先顺序码！1
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2楼2009-03-15 23:34:48
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federche

银虫 (小有名气)
谢谢回复。但是我需要定它的构型，给出一个初始构象。我用CHEMDRAW画图时存成mol文件时，就是标好构型的，但是hyperchem不认。侧链我已经知道怎么改，你的意思是环上的只能打开环了，那我要改的话具体怎么操作呢？

谢谢
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3楼2009-03-15 23:48:15
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xpc001

新虫 (小有名气)
谢谢回复。但是我需要定它的构型，给出一个初始构象。我用CHEMDRAW画图时存成mol文件时，就是标好构型的，但是hyperchem不认。侧链我已经知道怎么改，你的意思是环上的只能打开环了，那我要改的话具体怎么操作呢

我觉得在chemdraw中把两个都画出来，然后考到chem3D中，看看构型，如果构型对了，存为.mol文件，用hyperchem打开就行了，不行，在chem3d里改改，或者另外在chemdraw里再画一次。
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4楼2009-08-01 13:37:20
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LQ000323

金虫 (正式写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-2 13:32
四个原子序号按R或S排好，不要用加氢模型化的功能，而是可以先初步计算一下构型，基本就可以了，如果是环上的，要改变环要么开来与别的残基成新环
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5楼2009-08-01 14:51:58
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