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求助!BioEdit或者NCBI的本地BLAST软件作BLAST参数设置
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BioEdit或者NCBI的本地BLAST软件作BLAST,怎么设置为完全匹配啊? 例如,我手头的数据是大小不等的序列例如有的30nt,有的90nt等等,我希望批量跑了BLAST以后(与基因组比),Query序列与基因组的完全匹配的才显示。例如:如果有90nt长就仅显示90nt匹配的,如果有30net长就仅显示30nt的。 利用-W设置为30的话,90nt的Query序列就会出现大量的不完全匹配的冗余。 请问那个高手知道相关参数怎么设置。多谢啦!序列太多,用-W设置参数冗余太多,急啊。 |
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2楼2009-03-14 22:48:12
qqsvery
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