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小蒸鱼

新虫 (初入文坛)

[交流] 转录组学分析思路求助 已有2人参与

本人是新手,想研究绿藻SC降解1-甲基菲的相关降解基因,于是做了转录组学的测序。

该绿藻无全基因组序列,属于无参转录组测序。对降解基因的研究在藻类中甚少,在细菌和真菌中多。

我的思路是这样的:
公司已在各数据库中做好序列的功能注释
另外公司根据测序出的mRNA 提供了氨基酸序列 我用protein blast找到匹配度较高的序列 根据文献查询该序列表达的蛋白的功能 若相关 则用于做后续的基因功能验证

请教各位大神这个思路是否有问题?
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傻傻的守旧人

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
同问,请问楼主这个问题解决了吗?

发自小木虫Android客户端
2楼2018-04-05 13:51:23
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BioChen

银虫 (正式写手)

没有问题
3楼2018-05-01 22:41:45
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