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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » ME/Gulp » 在pdb里输入pi3kγ出现的蛋白中怎么选择哪个是我想要的？
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HelloYyang

新虫 (初入文坛)

[求助] 在pdb里输入pi3kγ出现的蛋白中怎么选择哪个是我想要的？ 已有1人参与

在PDB里找pi3kγ的蛋白出现各种与不同结构复合的人的蛋白晶体结构，输入pi3kγ之后出现很多，不知道该找哪个~文献里有用3APC（与CH5132799复合的人PI3K-γ的晶体结构）做分子对接的，但是我直接找出来的有2A4Z（与AS604850复合的人PI3Kgamma的晶体结构），请问：
1、这些不同PDB ID的结构是不是都是pi3kγ与配体结合之后形成的？就是说去掉配体之后剩下的结构都是一样的？
2、我如果做分子对接的话是不是需要把复合的配体去掉再和我准备的配体进行对接？
3、我用的是DS，该怎么操作去掉下载的晶体结构里的配体？@smutao
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1楼 2018-03-02 12:59:11
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匿名

用户注销 (正式写手)

不要再问DS了。
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
HelloYyang: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 太感谢了大神~ 2018-03-05 09:37:24
本帖仅楼主可见
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2楼2018-03-02 19:18:17
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