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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于gaussian中的二面角扫描

我用gaussian对一个分子中的某一个二面角进行扫描,一共扫描了180个点,每两度扫描一个点,关键词是scan。算完后发现结果有问题,这个角是环与另外一条侧链相连的二面角,我本想环是固定的,而分子的另外一部分即侧链会随着扫描一起转动,但是算完后,把180个点读出来发现结果不是这样,只有碳上的氢原子在转动,分子的两个部分都是固定的。请问这是什么原因造成的?我把out文件上传,请高人指点,谢谢。

http://www.namipan.com/d/temp.ou ... ba5c3c09e7c1ef31000
http://www.namipan.com/d/temp.out/3816783d2a1eaaf37d5e2ddbcba5dba5c3c09e7c1ef31000
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hjg9

木虫 (小有名气)

★ ★
yuhuobuku(金币+1,VIP+0):欢迎参加讨论 3-11 13:49
wuhanhgf2002(金币+1,VIP+0):非常感谢 3-12 19:02
建议扫描变量改为 D21
2楼2009-03-11 11:33:45
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

请问我的输入文件有没有错误?以前我在扫描某一个键长的时候,没有遇到这种问题。
3楼2009-03-11 14:37:50
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recoli

金虫 (正式写手)

★ ★
jghe(金币+1,VIP+0):谢谢你参与讨论! 3-11 20:25
wuhanhgf2002(金币+1,VIP+0):非常感谢 3-12 19:02
不能说输入文件有错误,但肯定是二面角没选好。可以试试一楼的办法啊。

或者你用PM3扫描一下稀疏的点,看看构型是不是按你所想的变化。如果不是就要想办法改动输入文件了。多尝试几次,以后就不怕类似问题了。
4楼2009-03-11 17:45:22
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