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Acousma

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问物种丰度聚类热图如何分析已有1人参与

物种丰度聚类热图是横向比较还是纵向比较,在文章中如何分析,看了几篇文献,没太看懂,如何看出优势菌群和相对丰度较高的菌群?

请问物种丰度聚类热图如何分析
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小冀-

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【答案】应助回帖

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snoopytbw: 金币+2, 专业指导,赞 2018-03-01 21:03:14
横向纵向都要比较吧,我觉得横向的是不同样本之间的差异,纵向是同一组样本内物种的分布情况,不知道这么理解对不对
···
2楼2018-03-01 11:10:57
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Acousma

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小冀- at 2018-03-01 11:10:57
横向纵向都要比较吧,我觉得横向的是不同样本之间的差异,纵向是同一组样本内物种的分布情况,不知道这么理解对不对

我理解的是横向比较是某一中菌在这几个样本中所占的相对丰度,相对丰度高则颜色深,但不一定是含量高
3楼2018-03-01 16:29:48
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小冀-

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引用回帖:
3楼: Originally posted by Acousma at 2018-03-01 16:29:48
我理解的是横向比较是某一中菌在这几个样本中所占的相对丰度,相对丰度高则颜色深,但不一定是含量高...

既然相对于其他菌株而言相对丰都比较大,是不是说明其数量占优势呢?
···
4楼2018-03-02 16:43:35
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