| 查看: 6820 | 回复: 2 | ||
sunshine???新虫 (职业作家)
|
[求助]
Pymol处理对接结果 已有1人参与
|
|
1.pymol如何改变氨基酸残基的Label的颜色，大小和位置 2.Pymol如何改变氢键的颜色，粗细 3.pymol如何改变distance的大小，位置和颜色 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
今年审到国自然15份，谈谈感受
已经有18人回复
-
26/27博士推荐
已经有5人回复
-
评审有感
已经有19人回复
-
献血感触
已经有11人回复
-
上海大学实验技术岗位非升即走
已经有12人回复
-
如何实现卤原子转化
已经有7人回复
-
云南大学材料与能源学院解琳课题组钙钛矿博士招生
已经有5人回复
-
2026山东省优青
已经有4人回复
-
反应很差，大量原料没有反应
已经有3人回复
-
Sci. Bull. 悲剧经验
已经有4人回复
zyx335588
捐助贵宾 (正式写手)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 6713.2
- 散金: 50
- 红花: 5
- 帖子: 459
- 在线: 417.5小时
- 虫号: 990100
- 注册: 2010-04-06
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sunshine???: 金币+10, ★★★很有帮助 2018-02-28 07:57:41
感谢参与，应助指数 +1
sunshine???: 金币+10, ★★★很有帮助 2018-02-28 07:57:41
|
1. （1）Label的大小，颜色和位置可以通过以下命令设置： set label_size, 14 #14，换成自己想设置的是大小 set label_color, red #red, 换成自己想设置的颜色 set label_position, (3,2,1) #(3,2,1)相对于原坐标在x，y，z轴上的偏移量 （2）Label的位置可以手动设置 点击pymol窗口右下角的Mouse Mode，将3-Button Viewing模式更改成3-Button Editing模式 按住ctrl，鼠标左键拖动Label，可以移动 按住ctrl和shift，鼠标左键拖动Label，可以在z轴上移动 label的详细设置，见https://pymolwiki.org/index.php/Label 2和3每有搞懂需求。 2中的氢键是用什么表示的呢？虚线（dash，自动找的）或者棍（stick，ligplot+导到pymol的），或者其他。 如果是虚线（dash），可以通过以下命令设置颜色，粗细 set dash_color, red #red，换成你需要的颜色 set dash_radius. 0.25 #0.25, 换成你需要的粗细（宽度） 如果是棍（stick），也类似 set stick_color, red set stick_radius, 0.25 3中的distance是根据坐标计算出来的，大小是不能改的，如果只是小数位数不同造成的四舍五入，可以用下面的命令更改 set label_distance_digits, 3 #3, 表示小数点后的位数 distance的数字就是一个Label，颜色、尺寸等都可以使用设置Label的方式更改。 |
2楼2018-02-27 20:59:58
小郑555
新虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 67.5
- 散金: 5
- 帖子: 25
- 在线: 5.5小时
- 虫号: 4041914
- 注册: 2015-08-28
- 性别: GG
- 专业: 生物物理、生物化学与分子
3楼2018-03-19 20:51:45
5