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sunshine???新虫 (职业作家)
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Pymol处理对接结果 已有1人参与
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1.pymol如何改变氨基酸残基的Label的颜色，大小和位置 2.Pymol如何改变氢键的颜色，粗细 3.pymol如何改变distance的大小，位置和颜色 发自小木虫Android客户端 |
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zyx335588
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【答案】应助回帖
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sunshine???: 金币+10, ★★★很有帮助 2018-02-28 07:57:41
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1. （1）Label的大小，颜色和位置可以通过以下命令设置： set label_size, 14 #14，换成自己想设置的是大小 set label_color, red #red, 换成自己想设置的颜色 set label_position, (3,2,1) #(3,2,1)相对于原坐标在x，y，z轴上的偏移量 （2）Label的位置可以手动设置 点击pymol窗口右下角的Mouse Mode，将3-Button Viewing模式更改成3-Button Editing模式 按住ctrl，鼠标左键拖动Label，可以移动 按住ctrl和shift，鼠标左键拖动Label，可以在z轴上移动 label的详细设置，见https://pymolwiki.org/index.php/Label 2和3每有搞懂需求。 2中的氢键是用什么表示的呢？虚线（dash，自动找的）或者棍（stick，ligplot+导到pymol的），或者其他。 如果是虚线（dash），可以通过以下命令设置颜色，粗细 set dash_color, red #red，换成你需要的颜色 set dash_radius. 0.25 #0.25, 换成你需要的粗细（宽度） 如果是棍（stick），也类似 set stick_color, red set stick_radius, 0.25 3中的distance是根据坐标计算出来的，大小是不能改的，如果只是小数位数不同造成的四舍五入，可以用下面的命令更改 set label_distance_digits, 3 #3, 表示小数点后的位数 distance的数字就是一个Label，颜色、尺寸等都可以使用设置Label的方式更改。 |
2楼2018-02-27 20:59:58
小郑555
新虫 (初入文坛)
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3楼2018-03-19 20:51:45