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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps模拟时为什么原子群会发生集体移动？是模拟有问题么？有没有什么解决办法？
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whu2015_8

新虫 (初入文坛)

[求助] lammps模拟时为什么原子群会发生集体移动？是模拟有问题么？有没有什么解决办法？ 已有1人参与

请求群里的各位大神惠赐指导！小弟使用lammps在nvt系综下做模拟，均是周期性边界，初始状态下原子群位于z方向的正中间（上下均有三倍于其长度的真空层），但是在模拟的过程中，发现原子群在z方向不断发生移动，并且能从z方向的一端移出去再从另一端移动进来！可是我的本意是想让这组原子在z方向的中间位置不动的，模拟时可以很顺利跑完的，但这样的移动是出乎我意料的，请问是不是我的模拟哪里出了问题呢？谢谢各位大神！
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1楼 2018-02-26 17:55:25
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无远不界

铁虫 (正式写手)
请给出in文件

发自小木虫Android客户端
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2楼2018-02-26 18:15:17
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
whu2015_8: 金币+10, ★有帮助, 非常感谢您的建议！昨天一个老师告诉我在中间很薄的一层进行setforce也可以，您的方法我稍后尝试一下，非常感谢！ 2018-02-27 19:14:36
尝试加上例如这个fix：
fix xxx all momentum 100 linear 0 0 1

参考：
http://lammps.sandia.gov/doc/fix_momentum.html
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3楼2018-02-26 23:54:32
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whu2015_8

新虫 (初入文坛)
已经找到解决方法了，就是需要在材料的中间某一层使用setforce进行固定，消除掉z方向的速度就可以了
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4楼2018-02-27 19:11:42
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by whu2015_8 at 2018-02-27 19:11:42
已经找到解决方法了，就是需要在材料的中间某一层使用setforce进行固定，消除掉z方向的速度就可以了

如果确定固定部分原子不影响所研究的目的，此法也可。
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5楼2018-02-28 05:06:28
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有风的日子qq

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by brucefan at 2018-02-28 05:06:28
如果确定固定部分原子不影响所研究的目的，此法也可。...

您好，要刚化某一区域，是用fix rigid command吗？
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6楼2018-05-04 09:16:34
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