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wangqiao

金虫 (小有名气)

[求助] 二代测序能否测准基因片段的3`和5`末端的序列?而不像一代要RACE?

大家知道,一代测序在扩增的时候使用固定引物,而引物往往需要结合在基因片段的3`和5`末端,所以即使能读到末端的碱基,也可能是引物的序列,所以通常需要通过RACE方法测定3`和5`的序列。本人只对二代测序有模糊的了解,不知道二代测序能否测准基因片段的3`和5`的序列,而不需要通过RACE方法?


感谢您的回复,顺祝新春愉快,狗年大吉!
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aishida

禁虫 (职业作家)

本帖内容被屏蔽

2楼2018-02-18 17:34:48
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wangqiao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by aishida at 2018-02-18 17:34:48
可以,二代测序是有固定接头的,测序结束之后会把那段已知序列去掉

就是不再需要RACE方法重新测定3`和5`末端的序列了?
3楼2018-02-18 17:46:22
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渊博震天

版主 (职业作家)

Yeast Display

优秀版主优秀版主

做race是用来测mRNA的非编码区序列的吧

发自小木虫Android客户端
4楼2018-02-18 20:02:11
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wangqiao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 渊博震天 at 2018-02-18 20:02:11
做race是用来测mRNA的非编码区序列的吧

谢谢至尊回复,我研究的是RNA病毒,片段两端一代PCR扩增测序法测不准,听前辈讲要用RACE测两端。但,现在有二代测序法,是不是就不需要RACE了。但又听二代的高手讲,二代测出的序列有些地方并不比一代好,特别是末端。听着好矛盾,所以上来问大侠们怎么处理末端序列的问题
5楼2018-02-18 20:47:10
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wangqiao

金虫 (小有名气)

继续求助,请有经验的二代高手出马!!
6楼2018-02-19 21:31:21
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