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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 二代测序能否测准基因片段的3`和5`末端的序列？而不像一代要RACE？
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wangqiao

金虫 (小有名气)

[求助] 二代测序能否测准基因片段的3`和5`末端的序列？而不像一代要RACE？

大家知道，一代测序在扩增的时候使用固定引物，而引物往往需要结合在基因片段的3`和5`末端，所以即使能读到末端的碱基，也可能是引物的序列，所以通常需要通过RACE方法测定3`和5`的序列。本人只对二代测序有模糊的了解，不知道二代测序能否测准基因片段的3`和5`的序列，而不需要通过RACE方法？


感谢您的回复，顺祝新春愉快，狗年大吉！
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1楼 2018-02-18 17:19:36
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aishida

禁虫 (职业作家)
本帖内容被屏蔽
2楼2018-02-18 17:34:48
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wangqiao

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by aishida at 2018-02-18 17:34:48
可以，二代测序是有固定接头的，测序结束之后会把那段已知序列去掉

就是不再需要RACE方法重新测定3`和5`末端的序列了？
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3楼2018-02-18 17:46:22
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渊博震天

版主 (职业作家)

Yeast Display

优秀版主优秀版主
做race是用来测mRNA的非编码区序列的吧

发自小木虫Android客户端
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4楼2018-02-18 20:02:11
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wangqiao

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 渊博震天 at 2018-02-18 20:02:11
做race是用来测mRNA的非编码区序列的吧

谢谢至尊回复，我研究的是RNA病毒，片段两端一代PCR扩增测序法测不准，听前辈讲要用RACE测两端。但，现在有二代测序法，是不是就不需要RACE了。但又听二代的高手讲，二代测出的序列有些地方并不比一代好，特别是末端。听着好矛盾，所以上来问大侠们怎么处理末端序列的问题
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5楼2018-02-18 20:47:10
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wangqiao

金虫 (小有名气)
继续求助，请有经验的二代高手出马！！
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6楼2018-02-19 21:31:21
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