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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » EMSA/ChIP » 求助利用什么方法可以确定原核微生物转录因子与基因结合方式及结合位点？？？
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zjf780526

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助利用什么方法可以确定原核微生物转录因子与基因结合方式及结合位点？？？

本人做细菌抗菌肽代谢调控，目前发现两个调控因子与抗菌肽合成有关，拟采取以下方式确定调控因子与抗菌肽合成酶基因的结合方式及结合位点.
1.利用基因敲除、HPLC确定调控因子对抗菌肽合成酶基因的调控作用。（正调控或副调控）
2.RT-PCR确定是否在转录水平调控
3.凝胶阻滞确定调控因子是否与启动子结合
4.DNAaseI试验确定结合位点
求助：
1.方案是否可行
2.具体如何确定结合位点？用什么软件？
本人没有相关试验基础，求助各位高手哦！
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1楼 2018-02-02 21:45:44
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土豆君

银虫 (小有名气)
可以，再加上一个ChIP实验，在体内验证一下就行
赞一下 回复此楼
爱基百客，提供专业级ChIP-seq、ATAC-seq、MeRIP-seq、RIP-seq等表观技术服务
3楼2018-03-05 09:06:33
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xzzhu

新虫 (小有名气)
CHIP

发自小木虫Android客户端
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2楼2018-02-03 00:54:49
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