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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » [求助]引物设计！
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synhily

木虫 (正式写手)

[交流] [求助]引物设计！

ATGAATTCTAGCTATACACAGAGATATGCACTGCCGAAGTGTATAGCAATATCAGATTATCTTTTCCATCGGCTCAACCAGCTGAACATACATACCATATTTGGACTCTCCGGAGAATTTAGCATGCCGTTGCTGGATAAACTATACAACATTCCGAACTTACGATGGGCCGGTAATTCTAATGAGTTAAATGCTGCCTACGCAGCAGATGGATACTCACGACTAAAAGGCTTGGGATGTCTCATAACAACCTTTGGTGTAGGCGAATTATCGGCAATCAATGGCGTGGCCGGATCTTACGCTGAACATGTAGGAATACTTCACATAGTGGGTATGCCGCCAACAAGTGCACAAACGAAACAACTACTACTGCATCATACTCTGGGCAATGGTGATTTCACGGTATTTCATAGAATAGCCAGTGATGTAGCATGCTATACAACATTGATTATTGACTCTGAATTATGTGCCGACGAAGTCGATAAGTGCATCAAAAAGGCTTGGATAGAACAGAGGCCAGTATACATGGGCATGCCTGTCAACCAGGTAAATCTCCCGATTGAATCAGCAAGGCTTAATACACCTCTGGATTTACAATTGCATAAAAACGACCCAGACGTAGAGAAAGAAGTTATTTCTCGAATATTGAGTTTTATATACAAAAGCCAGAATCCGGCAATCATCGTAGATGCATGTACTAGTCGACAGAATTTAATCGAGGAGACTAAAGAGCTTTGTAATAGGCTTAAATTTCCAGTTTTTGTTACACCTATGGGTAAGGGTACAGTAAACGAAACAGACCCGCAATTTGGGGGCGTATTCACGGGCTCGATATCAGCCCCAGAAGTAAGAGAAGTAGTTGATTTTGCCGATTTTATCATCGTCATTGGTTGCATGCTCTCCGAATTCAGCACGTCAACTTTCCACTTCCAATATAAAACTAAGAATTGTGCGCTACTATATTCTACATCTGTGAAATTGAAAAATGCCACATATCCTGACTTGAGCATTAAATTACTACTACAGAAAATATTAGCAAATCTTGATGAATCTAAACTGTCTTACCAACCAAGCGAACAACCCAGTATGATGGTTCCAAGACCTTACCCAGCAGGAAATGTCCTCTTGAGACAAGAATGGGTCTGGAATGAAATATCCCATTGGTTCCAACCAGGTGACATAATCATAACAGAAACTGGTGCTTCTGCATTTGGAGTTAACCAGACCAGATTTCCGGTAAATACACTAGGTATTTCGCAAGCTCTTTGGGGATCTGTCGGATATACAATGGGGGCGTGTCTTGGGGCAGAATTTGCTGTTCAAGAGATAAACAAGGATAAATTCCCCGCAACTAAACATAGAGTTATTCTGTTTATGGGTGACGGTGCTTTCCAATTGACAGTTCAAGAATTATCCACAATTGTTAAGTGGGGATTGACACCTTATATTTTTGTGATGAATAACCAAGGTTACTCTGTGGACAGGTTTTTGCATCACAGGTCAGATGCTAGTTATTACGATATCCAACCTTGGAACTACTTGGGATTATTGCGAGTATTTGGTTGCACGAACTACGAAACGAAAAAAATTATTACTGTTGGAGAATTCAGATCCATGATCAGTGACCCAAACTTTGCGACCAATGACAAAATTCGGATGATAGAGATTATGCTACCACCAAGGGATGTTCCACAGGCTCTGCTTGACAGGTGGGTGGTAGAAAAAGAACAGAGCAAACAAGTGCAAGAGGAGAACGAAAATTCTAGCGCAGTAAATACGCCAACTCCAGAATTCCAACCACTTCTAAAAAAAAATCAAGTTGGATACTGA


请设计上下游引物，包括1128~1704bp的全部或绝大部分，另外，引物长度最好大于23个bp.
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1楼 2009-03-05 18:22:57
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小猫三两只

金虫 (正式写手)
★
synhily(金币+1,VIP+0):退火温度和GC含量差的这么大也可以嘛? 3-5 22:05
上游引物:TAGCAAATCTTGATGAATCTAAACTGTC
   从1034个碱基开始 28bp 60.4度
下游引物:GCTCTGTTCTTTTTCTACCACCCA
   到1734结束  24bp 61.9度
扩出来的片段应该是1034到1734之间的片段.

给出的碱基很长,为什么你要的目的片段这么短,这样的话会有很多对引物,如果只包括1128~1704bp的全部或绝大部分,那么这对引物就可以用
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2楼2009-03-05 19:27:40
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synhily

木虫 (正式写手)
谢谢楼上的呀，还有没有高手，指教一二哦！
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3楼2009-03-06 12:05:08
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muchong5577

金虫 (正式写手)
楼主 你是要pcr做什么用的？准备使用司马载体？这样我们才好设计引物啊。
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4楼2009-03-06 12:55:45
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zjzz

木虫 (正式写手)

在通往变态的坦途上
就是，最好还要说明使用什么酶切位点之类的
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终于熬成木虫了……
5楼2009-03-06 15:10:36
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synhily

木虫 (正式写手)
我是做基因敲除的，用来连接pUC19质粒，黏末端连接。
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6楼2009-03-06 16:27:33
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synhily

木虫 (正式写手)
加BamHI
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7楼2009-03-06 16:28:56
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