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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 麻烦问一下
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哦可123456

新虫 (小有名气)

[交流] 麻烦问一下

最近筛到一株菌，菌液PCR验证16S是假单胞菌，峰图很纯，取同一瓶的菌提基因组，测16S是根瘤菌，峰图也是很纯，请问这是什么情况？怎么理解呢？

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1楼 2018-01-22 11:20:49
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
把16s序列全长拿去BLAST吧，不过现在美国政府关门了，genebank关了。。。。我觉得基因组的可能可信度高一点。PCR的不一定准确。
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2楼2018-01-22 12:22:26
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xuzhengnjut

新虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
16s鉴定很粗糙啊，取一些保守蛋白pcr综合判断下。另外结合伯杰士手册，做做唯一碳源培养看看

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3楼2018-01-22 12:33:37
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哦可123456

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xuzhengnjut at 2018-01-22 12:33:37
16s鉴定很粗糙啊，取一些保守蛋白pcr综合判断下。另外结合伯杰士手册，做做唯一碳源培养看看

好的，谢谢

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4楼2018-01-22 14:32:03
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哦可123456

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xuzhengnjut at 2018-01-22 12:33:37
16s鉴定很粗糙啊，取一些保守蛋白pcr综合判断下。另外结合伯杰士手册，做做唯一碳源培养看看

好的，谢谢

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5楼2018-01-22 14:32:16
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哦可123456

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by snoopytbw at 2018-01-22 12:22:26
把16s序列全长拿去BLAST吧，不过现在美国政府关门了，genebank关了。。。。我觉得基因组的可能可信度高一点。PCR的不一定准确。

好的，谢谢

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6楼2018-01-22 14:32:48
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