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morsom

铁虫 (小有名气)

[求助] 请教我,拿到LC-MS/MS非靶标代谢组学的数据以后怎么去给差异代谢物定性

1. 质谱是AB公司的,拿到的原始文件是wiff格式
2.已经有一个excell表,代谢物的质核比、保留时间、半定量数据已有
3.请问接下来怎么做,我才能去给代谢物定性?
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tanzhen

捐助贵宾 (著名写手)

qq3233511316专业分离结构鉴定


通过质谱图把化合物结构解析出来就可以了

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2楼2018-01-18 20:49:40
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morsom

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tanzhen at 2018-01-18 20:49:40
通过质谱图把化合物结构解析出来就可以了

谢谢您的回复
现在我是要找到差异代谢物以后,去看它的二级质谱图吗?可是我看不懂它到底是什么结构,对应哪个物质呀
3楼2018-01-18 21:27:17
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lxp930826

新虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by morsom at 2018-01-18 21:27:17
谢谢您的回复
现在我是要找到差异代谢物以后,去看它的二级质谱图吗?可是我看不懂它到底是什么结构,对应哪个物质呀...

没有数据库比对么?这个找差异一定是在数据库的帮助下才能做PCA

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4楼2018-01-18 21:54:41
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morsom

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lxp930826 at 2018-01-18 21:54:41
没有数据库比对么?这个找差异一定是在数据库的帮助下才能做PCA
...

谢谢您的回复

数据库应该是集成在软件上 才可以用吧?如果我没有定性软件,那么我就要手动去查数据库了吗?
5楼2018-01-19 11:43:46
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lxp930826

新虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by morsom at 2018-01-19 11:43:46
谢谢您的回复

数据库应该是集成在软件上 才可以用吧?如果我没有定性软件,那么我就要手动去查数据库了吗?...

数据库肯定是嵌入软件里使用的,手动查找费时费力,而且有偏差,还是得结合软件

发自小木虫Android客户端
6楼2018-01-19 16:32:06
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morsom

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by lxp930826 at 2018-01-19 16:32:06
数据库肯定是嵌入软件里使用的,手动查找费时费力,而且有偏差,还是得结合软件
...

请问有合适的软件推荐么?或者您熟悉AB公司的软件么?

发自小木虫IOS客户端
7楼2018-01-23 00:33:40
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lxp930826

新虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by morsom at 2018-01-23 00:33:40
请问有合适的软件推荐么?或者您熟悉AB公司的软件么?
...

AB是有代谢组学软件的,Marker View以及药代Lightsight,质谱数据软件PeakView,以及高通量分析平台DiscoveryQuant

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8楼2018-01-23 09:24:27
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