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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 分析 » 色谱质谱 » 请教我，拿到LC-MS/MS非靶标代谢组学的数据以后怎么去给差异代谢物定性
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morsom

铁虫 (小有名气)

[求助] 请教我，拿到LC-MS/MS非靶标代谢组学的数据以后怎么去给差异代谢物定性

1. 质谱是AB公司的，拿到的原始文件是wiff格式
2.已经有一个excell表，代谢物的质核比、保留时间、半定量数据已有
3.请问接下来怎么做，我才能去给代谢物定性？
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1楼 2018-01-18 19:35:07
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tanzhen

捐助贵宾 (著名写手)

qq3233511316专业分离结构鉴定
通过质谱图把化合物结构解析出来就可以了

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2楼2018-01-18 20:49:40
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morsom

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by tanzhen at 2018-01-18 20:49:40
通过质谱图把化合物结构解析出来就可以了

谢谢您的回复
现在我是要找到差异代谢物以后，去看它的二级质谱图吗？可是我看不懂它到底是什么结构，对应哪个物质呀
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3楼2018-01-18 21:27:17
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lxp930826

新虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by morsom at 2018-01-18 21:27:17
谢谢您的回复
现在我是要找到差异代谢物以后，去看它的二级质谱图吗？可是我看不懂它到底是什么结构，对应哪个物质呀...

没有数据库比对么？这个找差异一定是在数据库的帮助下才能做PCA

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4楼2018-01-18 21:54:41
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morsom

铁虫 (小有名气)
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4楼: Originally posted by lxp930826 at 2018-01-18 21:54:41
没有数据库比对么？这个找差异一定是在数据库的帮助下才能做PCA
...

谢谢您的回复

数据库应该是集成在软件上 才可以用吧？如果我没有定性软件，那么我就要手动去查数据库了吗？
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5楼2018-01-19 11:43:46
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lxp930826

新虫 (著名写手)
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5楼: Originally posted by morsom at 2018-01-19 11:43:46
谢谢您的回复

数据库应该是集成在软件上 才可以用吧？如果我没有定性软件，那么我就要手动去查数据库了吗？...

数据库肯定是嵌入软件里使用的，手动查找费时费力，而且有偏差，还是得结合软件

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6楼2018-01-19 16:32:06
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morsom

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by lxp930826 at 2018-01-19 16:32:06
数据库肯定是嵌入软件里使用的，手动查找费时费力，而且有偏差，还是得结合软件
...

请问有合适的软件推荐么？或者您熟悉AB公司的软件么？

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7楼2018-01-23 00:33:40
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lxp930826

新虫 (著名写手)
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7楼: Originally posted by morsom at 2018-01-23 00:33:40
请问有合适的软件推荐么？或者您熟悉AB公司的软件么？
...

AB是有代谢组学软件的，Marker View以及药代Lightsight，质谱数据软件PeakView，以及高通量分析平台DiscoveryQuant

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8楼2018-01-23 09:24:27
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