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lyvajc

新虫 (初入文坛)

[求助] 系统进化树 已有1人参与

求各位大佬帮忙看一下哪里有问题,为什么我在做16s序列比对的时候,先进行了blast 分析,从blast 分析的结果中找最近的属的所有的标准菌株建立进化树,结果我的菌株与标准菌株为什么不聚为一枝?但是blast分析结果都是99%以上。为什么求各位大佬帮忙指点

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二十一业

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

16s序列由于所承载的信息量有限,现在的物种分类学上,往往只用于判断属。
16s序列系统发生树也有可能与细菌的全基因组系统发生树相悖,所以,一些需要可靠菌种鉴定的工作中,需要利用全基因组进行菌种鉴定。
2楼2018-01-22 14:45:57
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