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peptide2882

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】计算顺反异构体能垒用Gamess合适吗

我是菜鸟,最近的工作需要计算一个二肽肽键的顺反异构体的能垒,看遍了本版的帖子,现在想向大家求证一下:我是不是必须要先计算出顺式和反式的过渡态,然后计算cis、trans、TS的能量,才能得到能垒。另外,我尽量想用免费软件,请问Gamess对我这样的菜鸟,做起来难度大吗?我也可以用别人实验室的正版Hyperchem,那么Hyperchem是否也可以完成我的工作呢?这两个软件用哪个好呢?
ps:我不怕困难,但就是时间紧,所以想请高手们为我的问题点评一下,以便于有方向的开始,谢谢大家!

[ Last edited by peptide2882 on 2009-3-1 at 10:07 ]
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终于变成木虫了
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loovfnd

至尊木虫 (著名写手)


yuhuobuku(金币+1):欢迎参加讨论
Gamess 这个软件熟悉起来比较困难,特别对于算激发态等等
莫强求!
2楼2009-03-01 13:08:17
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)


yuhuobuku(金币+1):欢迎参加讨论
gamess 的话,看它自带的文档,一定要详细地看,另外,仔细地读一下它带的例子……
3楼2009-03-01 13:38:05
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peptide2882

木虫 (正式写手)

谢谢朋友们的回答
终于变成木虫了
4楼2009-03-01 15:06:39
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xuefei06

木虫 (正式写手)


yuhuobuku(金币+1):欢迎参加讨论
曾计算过能量优化,Hyperchem 好像可以胜任你的任务,上手比较容易,并且你的同学又有正版的,你就学学呗,如果请你同学帮忙就更容易了
5楼2009-03-01 23:36:14
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peptide2882

木虫 (正式写手)

好的,谢谢斑竹指点,我现在到挺想试试GAMESS的了,最起码按上看看是个什么程度,看看有多花哨,嘿嘿,如果有问题,还会向各位请教的。
终于变成木虫了
6楼2009-03-02 00:35:09
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ccyb

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by peptide2882 at 2009-3-1 10:06:
我是菜鸟,最近的工作需要计算一个二肽肽键的顺反异构体的能垒,看遍了本版的帖子,现在想向大家求证一下:我是不是必须要先计算出顺式和反式的过渡态,然后计算cis、trans、TS的能量,才能得到能垒。另外,我尽量 ...

输入文件我可以帮你哦
7楼2009-10-12 21:48:20
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