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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 请教大神，两种细菌共培养如何定量每种菌？
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mircoakk

新虫 (初入文坛)
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10楼: Originally posted by snoopytbw at 2017-12-26 16:33:09
都是DNA还怎么反转录呀。。。目的基因选择的话，选特异性基因，通常都是选的特征性的毒力基因，内参通常用16s等...

如果用内参的话，肯定是mRNA水平。关键是，为啥用毒力基因？我是想看两个菌的共生作用呢，如果是这样的话，应该怎么挑选目的基因呢

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11楼2017-12-27 00:15:20
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xuexikuang


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12楼2017-12-27 00:44:40
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snoopytbw

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11楼: Originally posted by mircoakk at 2017-12-27 00:15:20
如果用内参的话，肯定是mRNA水平。关键是，为啥用毒力基因？我是想看两个菌的共生作用呢，如果是这样的话，应该怎么挑选目的基因呢
...

某些毒力基因具有菌种特异性。共生的话，肯定也会有代谢上的特异性酶，以此作为目的基因即可啊。查文献吧
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13楼2017-12-27 14:54:52
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mircoakk

新虫 (初入文坛)
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13楼: Originally posted by snoopytbw at 2017-12-27 14:54:52
某些毒力基因具有菌种特异性。共生的话，肯定也会有代谢上的特异性酶，以此作为目的基因即可啊。查文献吧...

关键是没有人做过体外培养证明过它们有共生关系，我们是根据肠道菌群16s结果，预测出来的。而且这种预测只能确定到菌属，无法确定到某一种菌株。现在就是想做，这个预测结果的验证实验，却无从下手

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14楼2017-12-28 00:30:32
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294005977

新虫 (初入文坛)
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14楼: Originally posted by mircoakk at 2017-12-28 00:30:32
关键是没有人做过体外培养证明过它们有共生关系，我们是根据肠道菌群16s结果，预测出来的。而且这种预测只能确定到菌属，无法确定到某一种菌株。现在就是想做，这个预测结果的验证实验，却无从下手
...

请问您现在想到什么好的方法了吗

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15楼2018-01-07 21:29:14
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by mircoakk at 2017-12-28 00:30:32
关键是没有人做过体外培养证明过它们有共生关系，我们是根据肠道菌群16s结果，预测出来的。而且这种预测只能确定到菌属，无法确定到某一种菌株。现在就是想做，这个预测结果的验证实验，却无从下手
...

这个，不太懂预测了。。。如果是菌群，不太好做验证，不妨你试试FISH吧，比如A和B共生的话，分别设计A和B的特异性序列互补的DNA探针就好了，混合菌，加探针，如果两种荧光都有，就是共生吧，我是这么理解的
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16楼2018-01-08 09:08:48
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