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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 菌种资源 » 怎样由基因序列，得到最接近的细菌种类，以及怎样再画出细菌进化树？
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逗腐乳

新虫 (小有名气)

[交流] 怎样由基因序列，得到最接近的细菌种类，以及怎样再画出细菌进化树？ 已有4人参与

怎样由基因序列，得到最接近的细菌种类，以及怎样再画出细菌进化树？

怎样由基因序列，得到最接近的细菌种类，以及怎样再画出细菌进化树？


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1楼 2017-12-14 20:06:34
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810763156

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
在ncbi上blast就可以了

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2楼2017-12-14 20:22:48
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逗腐乳

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 810763156 at 2017-12-14 20:22:48
在ncbi上blast就可以了

这个步骤我知道的，blast之后出现很多比对后的菌属，要怎么选择呢？我选择了一些，把他的基因序列导出来后，很多都是一样的好像？能不能给我详细讲讲？
怎样由基因序列，得到最接近的细菌种类，以及怎样再画出细菌进化树？-1


怎样由基因序列，得到最接近的细菌种类，以及怎样再画出细菌进化树？-2


怎样由基因序列，得到最接近的细菌种类，以及怎样再画出细菌进化树？-3



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3楼2017-12-14 21:03:13
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年少时的梦梦

新虫 (小有名气)
同问

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4楼2017-12-14 21:51:27
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碎梦醉蝶

新虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
然后在随便找一些其他的关系不太近的啊

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逗腐乳
5楼2017-12-14 22:01:28
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逗腐乳

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 碎梦醉蝶 at 2017-12-14 22:01:28
然后在随便找一些其他的关系不太近的啊

能不能给我讲一讲啊，怎么样才算是关系不相近的啊？然后有这些数据如何画出细菌进化树啊？求助

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6楼2017-12-15 11:18:49
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dan_nn

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
snoopytbw: 金币+3, 鼓励 2017-12-15 20:42:29
可以用MEGA软件导入数据，绘制。引用网上搜索到的文章让你参考
https://www.cnblogs.com/leezx/p/6215402.html
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逗腐乳
7楼2017-12-15 15:59:50
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逗腐乳

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by dan_nn at 2017-12-15 15:59:50
可以用MEGA软件导入数据，绘制。引用网上搜索到的文章让你参考
https://www.cnblogs.com/leezx/p/6215402.html

嗯嗯，明白了。不行再问你，哈

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8楼2017-12-15 17:51:22
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