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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 碳纳米管和金颗粒。
汕头大学海洋科学、生物学、生物与医药接受调剂
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csutzk

木虫 (小有名气)

[求助] 碳纳米管和金颗粒。 已有1人参与

碳纳米管和金颗粒如何建立在同一个模型里面。用什么可以完成么？MS可以做碳纳米管。lammps可以做银颗粒。

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1楼 2017-12-13 19:17:20
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zx108s221

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用VMD集合一下再输出不就行了
但是有可能输出的并不完全正确，得手动修改
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

csutzk
I'maslowlywalker,butIneverwalkback.
2楼2017-12-14 18:15:39
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csutzk

木虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zx108s221 at 2017-12-14 18:15:39
用VMD集合一下再输出不就行了
但是有可能输出的并不完全正确，得手动修改

VMD好像不可以直接做银颗粒。可否只输出碳纳米管，然后再in文件中把银崽lammps里面建模呢

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3楼2017-12-14 20:55:29
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zx108s221

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by csutzk at 2017-12-14 20:55:29
VMD好像不可以直接做银颗粒。可否只输出碳纳米管，然后再in文件中把银崽lammps里面建模呢
...

这么做没问题的
只要VMD输出的碳纳米管data文件格式正确就行
同一个in文件可以read多个data也可以lammpps自带建模组合的
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I'maslowlywalker,butIneverwalkback.
4楼2017-12-20 00:12:59
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csutzk

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zx108s221 at 2017-12-20 00:12:59
这么做没问题的
只要VMD输出的碳纳米管data文件格式正确就行
同一个in文件可以read多个data也可以lammpps自带建模组合的...

那要如何区分两个readate的原子呢。您有类似的in文件可以参考么？只需要那一小段。

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5楼2017-12-20 00:16:39
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zx108s221

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by csutzk at 2017-12-20 00:16:39
那要如何区分两个readate的原子呢。您有类似的in文件可以参考么？只需要那一小段。
...

原子种类就定义成不一样的
比如data里面C是1
那你生成Au就设成2
有这时间问你自己都试出来了
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I'maslowlywalker,butIneverwalkback.
6楼2017-12-20 23:48:52
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