应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 【求助】：大分子结构优化【chemoffice6.0 】
181/2返回列表12下一页
查看: 1734  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

JOJOFIY

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】：大分子结构优化【chemoffice6.0 】

我在chemoffice6.0 中用MOPAC的PM3对化合物的分子构型进行了优化，但是有几个分子的分子量较大，超过了运算范围，该如何解决问题呢？请各位大侠出手相助。
分子式：C134H112N12O5
           C182H160N20O9
目前正在尝试半支烟的方法逐步优化分子构型，但是发现很耗时间。希望得到指点。

经过一天的尝试，以失败告终，各位高人继续指教。

[ Last edited by cadick on 2009-12-14 at 02:49 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2009-02-27 16:32:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
★ ★
JOJOFIY(金币+1):谢谢参与
JOJOFIY(金币+1,VIP+0):谢谢，但是我没有装这个，我之前没有搞过计算 2-27 19:50
是多大的分子？
用普通的分子力学方法，比如sybyl中的SD，CG方法不可以么？
赞一下(4人) 回复此楼
个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
2楼2009-02-27 17:41:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuyihua

铁杆木虫 (小有名气)
★ ★
JOJOFIY(金币+1):谢谢参与
JOJOFIY(金币+1,VIP+0):谢谢，您说的是不是还需要安装另一个 软件辅助，我电脑中没哟你说的这个 2-27 19:53
机子配置好的可以用Material Studio，差的话可以用VMD+NAMD或Tinker，另外对大分子最好用分子力学或分子动力学的方法，这样效率高。
赞一下(4人) 回复此楼
3楼2009-02-27 17:54:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

半支烟5591

铜虫 (正式写手)

专家
★ ★
JOJOFIY(金币+1):谢谢参与
JOJOFIY(金币+1,VIP+0):这个办法不错，就是我不知道怎样具体实施，可以说的再具体写吗，我的原子数比较多 2-27 19:54
可以尝试，从小基组一步一步优化，也可以把整个分子分开，优化完一部分后，再添一部分优化，直到最后整个分子优化完毕！
赞一下(4人) 回复此楼
4楼2009-02-27 19:33:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

半支烟5591

铜虫 (正式写手)

专家
★
JOJOFIY(金币+1,VIP+0):谢谢 2-27 19:55
如果实在不行，就得换服务器了！
赞一下(3人) 回复此楼
5楼2009-02-27 19:34:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

半支烟5591

铜虫 (正式写手)

专家
★ ★ ★ ★
fegg7502(金币+3,VIP+0):说的对 2-27 20:43
JOJOFIY(金币+1,VIP+0):怎么冻结，希望能指点一下 3-2 15:16
我也只是听导师说过，没具体干过，就是说可以吧大分子拆开，你比如说先弄个7个碳原子的长链优化，找到稳定构型后，再在图形软件里，把苯环什么的加上去，再优化，之后再加余下的部分，直到分子全部对完，少量多次，这样的话比较麻烦但对付大分子有用，因为一下给个大分子不是找不到稳定构型就是你说的这种情况。还一种方法有说是可以把分子的一部分先冻结，再优化，减少计算量！你可以试试，做科学吗！
赞一下(12人) 回复此楼
6楼2009-02-27 20:13:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fegg7502
★ ★
JOJOFIY(金币+1):谢谢参与
JOJOFIY(金币+1,VIP+0):？路过么 3-2 15:17
7楼2009-02-27 20:44:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
JOJOFIY(金币+1):谢谢参与
JOJOFIY(金币+1,VIP+0):多么希望能得到详细指点啊 3-2 15:18
核心部位用量化，外层用分子力学手段。
赞一下(3人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
8楼2009-02-28 17:46:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ustc

金虫 (著名写手)
★
JOJOFIY(金币+1):谢谢参与
多大的分子，展现一下，看看大家是否可以帮得上忙的
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2009-03-02 16:53:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hzzx

铜虫 (小有名气)
★
JOJOFIY(金币+1):谢谢参与
MM+QM
回复此楼
哎。。苦恼啊。。。
10楼2009-04-15 23:30:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 JOJOFIY 的主题更新
181/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 5/250 2026-09-14 16:25 by Aj1rhIDL5ixY
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:12 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:00 by Aj1rhIDL5ixY
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:57 by Aj1rhIDL5ixY
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:48 by Aj1rhIDL5ixY
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:45 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:37 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:13 by Aj1rhIDL5ixY
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 3/150 2026-09-14 15:09 by Aj1rhIDL5ixY
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:01 by Aj1rhIDL5ixY
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 6/300 2026-09-14 15:00 by Aj1rhIDL5ixY
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 3/150 2026-09-14 14:57 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-14 12:35 by 40ms4Wlo4umh
[基金申请] 求教各位大神：2026教育部人文社科青年基金项目何时公示呀？ +5 云宴山人 2026-09-10 7/350 2026-09-14 12:11 by ecnu2013
[找工作] 浙江师范大学是怎么坑我的 +6 recruit123 2026-09-09 6/300 2026-09-14 12:00 by 萨仁其其格
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-14 10:01 by 23jxep3nCNZb
[考博] 西北工业大学材料学院电化学传感与催化课题组招收2027年推免研究生、博士生、博士后 +3 马方园 2026-09-10 4/200 2026-09-14 09:29 by Chem张zz
[考博] 27秋季材料博士申请求助 10+3 Cahal1 2026-09-11 4/200 2026-09-14 08:50 by 北京莱茵编辑
[教师之家] 浙江师范大学是怎么坑我的 +10 recruit123 2026-09-09 15/750 2026-09-13 10:45 by seaskyy
[有机交流] 科研求助 10+4 我吃一只鱼 2026-09-07 4/200 2026-09-10 08:32 by 0940628
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭