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汕头大学海洋科学、生物学、生物与医药接受调剂
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localxinran

金虫 (正式写手)

[求助] 请教各位大神,lammps的data文件如何得到 已有2人参与

我在网上看了一些帖子都是用ms建模导出的,导师希望只用lammps的自带功能,想请问一下想放入高分子链,怎么放到lammps中去。请各位大神指点一二…谢谢

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cl1994861

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
lammps自带的一些命令应该是实现不了放入高分子链这么复杂的建模的(如果可以那也非常复杂。。。)
2楼2017-11-29 17:35:04
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localxinran

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cl1994861 at 2017-11-29 17:35:04
lammps自带的一些命令应该是实现不了放入高分子链这么复杂的建模的(如果可以那也非常复杂。。。)

那请问一下,用什么完成建模呢?您是用什么方法啊

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3楼2017-11-29 19:13:37
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zx108s221

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by localxinran at 2017-11-29 19:13:37
那请问一下,用什么完成建模呢?您是用什么方法啊
...

为啥希望只用自带功能?
自带功能实现稍微复杂一点的结构都极其麻烦 更何况你这种高分子链不是晶格结构那样的
如果ms能实现,未尝不可以?
I'maslowlywalker,butIneverwalkback.
4楼2017-11-29 21:26:01
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jluchemlib

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
自己写一个code就可以了,输出格式与data文件匹配就行
5楼2017-11-30 08:46:14
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cl1994861

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by localxinran at 2017-11-29 19:13:37
那请问一下,用什么完成建模呢?您是用什么方法啊
...

我一般用的是MS建模,然后再导出data文件,应该还有的软件可以实现建模功能,你去lammps官网看看,我记得对于这种高分子应该是有专门的软件的
6楼2017-11-30 09:01:01
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大懒猫王浩

金虫 (著名写手)

学渣

高分子,生物分子不是有专门的那个叫amber的蛮,lammps支持把里面东西弄出来。。

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一步一步往上走,,,,
7楼2017-11-30 09:19:00
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localxinran

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zx108s221 at 2017-11-29 21:26:01
为啥希望只用自带功能?
自带功能实现稍微复杂一点的结构都极其麻烦 更何况你这种高分子链不是晶格结构那样的
如果ms能实现,未尝不可以?...

我们想要研究的就是高分子结晶,请问应该用什么语句实现

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8楼2017-11-30 09:47:14
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localxinran

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by jluchemlib at 2017-11-30 08:46:14
自己写一个code就可以了,输出格式与data文件匹配就行

是用c++编写么?您有例子么?能借我参考一下么,我是个小白什么都不懂,就会一点c++语言

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9楼2017-11-30 09:49:21
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localxinran

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 大懒猫王浩 at 2017-11-30 09:19:00
高分子,生物分子不是有专门的那个叫amber的蛮,lammps支持把里面东西弄出来。。

研究的是分子结晶,应该是物理材料

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10楼2017-11-30 09:51:41
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