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雪梅li

新虫 (初入文坛)

[求助] 没有目的片段的已知简并引物

我从文章里找到的引物,但是是简并核酸序列,然后文章也没有给目的片段的长度,给了这个目的基因的氨基酸序列,我想请教,怎么才能知道我的目的片段长度?还有有什么方法把氨基酸序列转化能核酸序列,有没有大神有软件分享的?万分感谢!我今天刚注册,唯一的五个金币

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chen卡神

新虫 (小有名气)

2楼2017-11-29 00:49:01
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chen卡神

新虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-11-29 07:48:59
直接丢进blast ,通过氨基酸比对到碱基,就可以了

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3楼2017-11-29 00:50:39
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雪梅li

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by chen卡神 at 2017-11-29 00:50:39
直接丢进blast ,通过氨基酸比对到碱基,就可以了

比对了,但是只找到了上游引物,下游引物找不到是什么原因?我的目的基因是一个大群的管家基因,并不是单个物种的

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4楼2017-11-29 01:24:37
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花鸟画夜

新虫 (初入文坛)

下游引物输入反向互补序列

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5楼2017-12-04 12:40:29
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soarrow

铁杆木虫 (正式写手)

酱油歪楼党

给查到的那个文章的作者发邮件请教,或者pubmed能够查到做同样的内容,也可以发邮件给作者们请教。
然后还可以看看你查到的那个文章都被什么文章给引用了,找找线索就有希望
6楼2017-12-06 04:39:32
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soarrow

铁杆木虫 (正式写手)

酱油歪楼党

另外,如果那个文章“给了这个目的基因的氨基酸序列”,那么核酸序列可以通过NCBI BLAST的tblastn来查找....这个挺容易的
7楼2017-12-06 04:42:55
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