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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 没有目的片段的已知简并引物
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雪梅li

新虫 (初入文坛)

[求助] 没有目的片段的已知简并引物

我从文章里找到的引物，但是是简并核酸序列，然后文章也没有给目的片段的长度，给了这个目的基因的氨基酸序列，我想请教，怎么才能知道我的目的片段长度?还有有什么方法把氨基酸序列转化能核酸序列，有没有大神有软件分享的？万分感谢！我今天刚注册，唯一的五个金币

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1楼 2017-11-29 00:44:11
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chen卡神

新虫 (小有名气)
ncbi

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2楼2017-11-29 00:49:01
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chen卡神

新虫 (小有名气)
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-11-29 07:48:59
直接丢进blast ,通过氨基酸比对到碱基，就可以了

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3楼2017-11-29 00:50:39
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雪梅li

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by chen卡神 at 2017-11-29 00:50:39
直接丢进blast ,通过氨基酸比对到碱基，就可以了

比对了，但是只找到了上游引物，下游引物找不到是什么原因？我的目的基因是一个大群的管家基因，并不是单个物种的

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4楼2017-11-29 01:24:37
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花鸟画夜

新虫 (初入文坛)
下游引物输入反向互补序列

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5楼2017-12-04 12:40:29
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soarrow

铁杆木虫 (正式写手)

酱油歪楼党
给查到的那个文章的作者发邮件请教，或者pubmed能够查到做同样的内容，也可以发邮件给作者们请教。
然后还可以看看你查到的那个文章都被什么文章给引用了，找找线索就有希望
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6楼2017-12-06 04:39:32
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soarrow

铁杆木虫 (正式写手)

酱油歪楼党
另外，如果那个文章“给了这个目的基因的氨基酸序列”，那么核酸序列可以通过NCBI BLAST的tblastn来查找....这个挺容易的
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7楼2017-12-06 04:42:55
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