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二次PCR无法扩增
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流光色
新虫
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注册: 2017-10-22
专业: 病毒学
[
求助
]
二次PCR无法扩增
已有1人参与
这个2000BP的片段一直是我们P不出来的,我偶然一次P出来了一条很亮的带,之后酶切切胶回收
然后连接一直连不上,做了二次PCR,用的第一次的前引物和目的片段的后引物,P出来的是很长一条暗淡的带
我这是假阳性还是我的片段降解了
我的前后引物Tm值是64和71,PCR用的57°C,后面也一直P不出来了
时间设置是95℃5min 95℃30S 57℃30S 72℃1min20s,72℃10min,感觉也没什么问题,但是第一次之后就再也P不出来了
加了DMSO
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1楼
2017-11-27 12:40:40
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kangaroo0513
新虫
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红花: 29
帖子: 464
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注册: 2013-08-28
专业: 细胞物质运输
【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
先试gradient..........................
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2楼
2017-11-27 14:02:47
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yuangauss
铁虫
(初入文坛)
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虫号: 4923318
注册: 2016-08-17
性别: GG
专业: 微生物遗传育种学
PCR产物做模板是不太好,可以在PCR体系中添加0.9-2%的DMSO,增加扩增效率,或者将其连到平端或T载体上,测序验证正确后用连接好的质粒做模板就可以了,或者尝试换个引物位点,重新设计一对引物,重新扩增
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3楼
2017-11-30 22:33:37
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