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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】vasp输入文件问题
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乐乐9138

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】vasp输入文件问题

各位前辈，我最近买了个机器准备单机计算，装上了linux操作系统。当我把四个输入文件放进去运行时，它提示：there should be 1 or 3 three items on the line 2 of the poscar.但当我检查时明明在第二行有东西，请问，这是怎么回事

[ Last edited by wuchenwf on 2009-6-22 at 22:33 ]
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博学笃志，格物明德
1楼 2009-02-25 09:04:28
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netx_ray

木虫 (小有名气)
★ ★
乐乐9138(金币+1):谢谢参与
wuchenwf(金币+1):谢谢参与
可能是Linux和window下文本文件的换行符不同引起的吧

你的配置文件在windows下编辑过吗？

dos2unix 文件一下试试
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2楼2009-02-25 12:12:46
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limaojlu

金虫 (正式写手)
★ ★
乐乐9138(金币+1):谢谢参与
wuchenwf(金币+1):谢谢参与
如果你在WINDOWS编辑过的话就很容易出问题了，给你提示从新写过吧，比如你从MATERIAL STUDIO 得来CELL 文件后，先不编辑，拿到LINUX下重新编辑过。
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3楼2009-02-25 19:49:52
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liuds7792

金虫 (小有名气)
★ ★
乐乐9138(金币+1):谢谢参与
wuchenwf(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by netx_ray at 2009-2-25 12:12:
可能是Linux和window下文本文件的换行符不同引起的吧

你的配置文件在windows下编辑过吗？

dos2unix 文件一下试试

同意！！！！！
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合作
4楼2009-02-25 21:14:24
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liuds7792

金虫 (小有名气)
★
fegg7502(金币+1,VIP+0):鼓励交流！ 2-27 21:11
引用回帖:
Originally posted by limaojlu at 2009-2-25 19:49:
如果你在WINDOWS编辑过的话就很容易出问题了，给你提示从新写过吧，比如你从MATERIAL STUDIO 得来CELL 文件后，先不编辑，拿到LINUX下重新编辑过。

有点麻烦，我在windows下编辑文件，然后在linux下用从没出问题
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合作
5楼2009-02-25 21:16:07
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
★
乐乐9138(金币+1):谢谢参与
确实，有的时候很严重，而且楼主反映的这种莫名其妙的错误和可能是这个
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6楼2009-02-27 20:40:00
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tfh00

银虫 (小有名气)
★
乐乐9138(金币+1):谢谢参与
LINUX下重新编辑
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7楼2009-02-28 09:00:15
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veryman

木虫 (正式写手)

$_$
★
乐乐9138(金币+1):谢谢参与
可以在用ftp传文件的时候指定一下用ACSII码，这样就可以把windows里面的换行符换成linux下的了
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8楼2009-02-28 13:09:24
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乐乐9138

银虫 (正式写手)
我的输入文件确实再windows下编辑的，拿到linux下提交任务的时候我使用了文件格式转换dos2unix,可是它给出一句：error reading  item "IMAGES" from the INCAR. 但是实际上我的incar文件中就没有设置这个选项。真的有点棘手还有点急，还请各位前辈多多帮忙
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博学笃志，格物明德
9楼2009-03-02 21:38:56
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huangyc

木虫 (正式写手)
★
乐乐9138(金币+1):谢谢参与
是不是你编译的是串行版的VASP啊，NEB需要的是并行的VASP
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10楼2009-03-02 22:13:36
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