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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】CASTEP计算failure,急！
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nicholasyp

铁杆木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】CASTEP计算failure,急！

设置了96个原子的supercell，用castep做计算时，不到十分钟，弹出对话框the job has failed. Download any results generated so far?

不知道是什么原因，还请大牛们指导一下我这个新手，每周要汇报，没结果交不了差啊！

可能是计算量太大，超过disk的原因吗？

+---------------- MEMORY AND SCRATCH DISK ESTIMATES PER NODE -----------------+
|                                                     Memory          Disk    |
| Model and support data                              822.4 MB       484.5 MB |
| Electronic energy minimisation requirements         778.1 MB       392.7 MB |
|                                               ----------------------------- |
| Approx. total storage required per node            1600.5 MB       877.2 MB |
|                                                                             |
| Requirements will fluctuate during execution and may exceed these estimates |
+-----------------------------------------------------------------------------+

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-21 at 20:57 ]
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1楼 2009-02-24 10:14:01
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守望者7981

银虫 (初入文坛)

关注

★
nicholasyp(金币+1,VIP+0):就是内存的问题 2-26 14:02
有可能吧
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2楼2009-02-24 10:28:57
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wuli8

荣誉版主 (知名作家)

…………

优秀版主优秀版主
★ ★
nicholasyp(金币+2,VIP+0):有可能吧 2-25 02:34
96个原子的supercell
什么体系？
你的计算机是什么配置？
有可能是内存小了
赞一下(2人) 回复此楼
…………
3楼2009-02-24 10:39:11
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nicholasyp

铁杆木虫 (小有名气)
UO2,文献上都是用96个原子，我开始用我自己的电脑，后来用的是8G的服务器，都是failure，苦闷啊，明天就要开组会了，还没算出来。
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4楼2009-02-24 12:51:27
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nicholasyp

铁杆木虫 (小有名气)
今天用相同的条件算了一个12个atom的cell，没什么问题，感觉应该是96 atoms太多了，但是我们的一个博后告诉我他算过200多个原子的，也没出现job failed，只是花的时间长点。
赞一下 回复此楼
5楼2009-02-25 08:51:51
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nicholasyp

铁杆木虫 (小有名气)
★
zxzj05(金币+1,VIP+0):xiexie 期待多参与讨论！ 2-25 13:41
看来是内存不够，用dmol3算，同样是job failed，并给出了原因：
insufficient memory for this job
Error: failed allocating memory
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting

不过看到需要的内存量，不知道可不可以修改什么参数加大内存啊，例如虚拟内存，从而使计算可以进行？

real array elements, matrices vectors etc:    1541.3 MB
integer arrays                           :      12.0 MB
min recommended for all-incl workspace   :    1553.0 MB
Total memory allocated for arrays         :    1599.9 MB

disk space needed for TPSMX (r)      967.6 MB
per k-point (     1) for TPVEC       135.1 MB
Total disk space needed for TPVEC       0.14 GB
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6楼2009-02-25 13:02:00
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
nicholasyp(金币+2,VIP+0):有希望了！ 2-25 14:17
nicholasyp(金币+3,VIP+0):成功 2-26 14:03
nicholasyp(金币+2,VIP+0):对了 3-26 05:09
在job里面有个控释，如果选memory而不是speed，则可减少内存负担，但计算时间将会被延长。
赞一下(3人) 回复此楼
储氢家族欢迎储氢研究者！
7楼2009-02-25 13:43:32
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nicholasyp

铁杆木虫 (小有名气)
具体怎么操作啊，能不能稍微具体一下，十分感谢zxzj05，看到希望了！
赞一下 回复此楼
8楼2009-02-25 14:10:24
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)
★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢你的热情回答，欢迎常来 3-27 18:43
打开计算的模型，
用castep开始计会有setup的计算参数控制界面，转换到job控释标签下，
这个界面下没几个参数可选，都是下来菜单，
其中有单核双核等的核数量选择，
还有就是内存使用选择：选memory而不是speed就可以了。
赞一下(12人) 回复此楼
储氢家族欢迎储氢研究者！
9楼2009-03-26 09:38:33
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