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dovekaoyan

木虫 (正式写手)

[求助] 从过滤膜上提取DNA 已有2人参与

如题,我的目标水体中微生物含量很少,我用0.22um的膜过滤截留细菌,然后想从膜上提取基因组DNA,尝试了两种方法,一种是采用天根的土壤基因组DNA提取的试剂盒法,一种是CTAB手提。可是发现,前种方法一次只能用来处理很少量的膜,大约1/4块膜,可是我的膜上的生物量本来就不大,这样应用于提取的生物量更少,下一步实验DNA量不够;后一种手提法,虽说可以扩大提取体系,但是提取过程中可能因为膜被破坏的问题,掺杂了很多非核酸物质,DNA降解也很严重。不知道大家有什么好的方法没有?
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酷莱博

新虫 (小有名气)

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2017-11-24 07:57:38
滤膜上的微生物没法刮下来是吧?那只能跟滤膜一起处理了,把滤膜当成植物叶片,液氮研磨或者匀浆碎,就用CTAB就行了,多处理一会,低速离心把杂质不溶物沉下去。然后酚氯仿抽提一下,想要量大一些就直接上清沉淀,也可以借用天根那个吸附柱,你上清加他家的上柱液挂柱,接着试剂盒后续操作就行了。一般这个微生物检测是做pcr吧,有一点出来就能做,讲不降解不是很重要

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2楼2017-11-19 18:17:36
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dovekaoyan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 酷莱博 at 2017-11-19 18:17:36
滤膜上的微生物没法刮下来是吧?那只能跟滤膜一起处理了,把滤膜当成植物叶片,液氮研磨或者匀浆碎,就用CTAB就行了,多处理一会,低速离心把杂质不溶物沉下去。然后酚氯仿抽提一下,想要量大一些就直接上清沉淀,也 ...

滤纸一起处理后发现最后出现很多白色胶状物,一开始以为是DNA,可检测发现没条带

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3楼2017-11-23 16:02:06
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lm880729

新虫 (初入文坛)

天津兰瑞 有一个微量提取试剂盒,号称4cfu/ml,都能提取。可以试一试。
4楼2017-12-14 16:11:15
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小马科研部落

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
dovekaoyan: 金币+10, ★★★很有帮助 2017-12-16 16:18:49
可以用CTAB的方法,前提是将滤膜上的微生物,用PBS洗下来,测PBS里面的。
更多内容,请关注微信公众号【小马科研部落】,有问题可找QQ308091253
5楼2017-12-15 16:46:25
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梅西大哥梅东

新虫 (正式写手)

滤膜先用缓冲液震荡洗下来啊,再离心

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6楼2018-06-13 14:57:07
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柒橙0327

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

可以先用纤维素酶把滤膜溶解
7楼2018-10-30 14:33:14
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8楼2018-11-02 07:14:00
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