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YoungNann

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
10楼: Originally posted by silentmlight at 2017-11-15 22:08:28
chmod 不是提交只是加权限...搞清是什么作业调度系统,e.g. pbs 用qsub,slurm用srun

哦,明白了
我输入qsub和srun命令都显示not found 是不是表明我这里不是PBS和SLURM的作业调度系统?
现在不清楚用的是什么作业调度系统,大侠指导指导能否查到作业调度系统或还有什么其他的命令
多谢
11楼2017-11-16 08:30:22
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YoungNann

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 逗比装傲娇 at 2017-11-15 19:17:06
chmod +x 脚本

用了这个命令虽然没报错但作业还是没有跑啊、。。。
12楼2017-11-16 08:31:48
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silentmlight

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
11楼: Originally posted by YoungNann at 2017-11-16 08:30:22
哦,明白了
我输入qsub和srun命令都显示not found 是不是表明我这里不是PBS和SLURM的作业调度系统?
现在不清楚用的是什么作业调度系统,大侠指导指导能否查到作业调度系统或还有什么其他的命令
多谢...

你们组自己的服务器就问师兄,超算中心就问管理员,难道是你第一个用户

发自小木虫Android客户端
13楼2017-11-16 08:59:07
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YoungNann

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
13楼: Originally posted by silentmlight at 2017-11-16 08:59:07
你们组自己的服务器就问师兄,超算中心就问管理员,难道是你第一个用户
...

这个服务器才装上不久,前几天请人把vasp装上。
我问那个装vasp的人怎么提交作业和跑作业,他表示他也不清楚。。。。我也很无奈

发自小木虫Android客户端
14楼2017-11-16 09:11:04
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silentmlight

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
那应该是没装排队,直接跑vasp吧,用mpirun或者mpiexec引导

发自小木虫Android客户端
15楼2017-11-16 09:13:57
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YoungNann

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
15楼: Originally posted by silentmlight at 2017-11-16 09:13:57
那应该是没装排队,直接跑vasp吧,用mpirun或者mpiexec引导

那我是不是可以直接输命令
mpirun -np 4 vasp_std
就可以跑了呢
16楼2017-11-16 09:18:43
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YoungNann

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
15楼: Originally posted by silentmlight at 2017-11-16 09:13:57
那应该是没装排队,直接跑vasp吧,用mpirun或者mpiexec引导

用mpirun -np 4 vasp_std试了一下
报错了,不知道是什么情况
vasp做计算时提交作业
搜狗截图20171116092303.jpg

17楼2017-11-16 09:25:04
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silentmlight

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不是命令的时,库没链接上,你在bashrc里链接export一下

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

18楼2017-11-16 11:44:35
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YoungNann

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
18楼: Originally posted by silentmlight at 2017-11-16 11:44:35
不是命令的时,库没链接上,你在bashrc里链接export一下

具体如何在bashrc里export
(如何打开.bashrc进行export,能具体讲讲吗)
谢谢大佬指点

发自小木虫Android客户端
19楼2017-11-16 12:06:21
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silentmlight

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
19楼: Originally posted by YoungNann at 2017-11-16 12:06:21
具体如何在bashrc里export
(如何打开.bashrc进行export,能具体讲讲吗)
谢谢大佬指点
...

不好说清楚,搜一下 vasp export 环境变量 等关键词吧,网上很多教程,good luck

发自小木虫Android客户端
20楼2017-11-16 12:21:57
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