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R+HiC

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
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虫号: 7121317
注册: 2017-08-30
专业: 发育生物学

[交流] 测序结果文库接头污染是什么问题？已有1人参与

做HiC或者Chip中发现测序的文库接头中接头污染，导致文库不合格如何解决

发自小木虫IOS客户端

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1楼 2017-11-13 00:23:19

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atikou

铜虫 (小有名气)

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专业: 基因表达调控与表观遗传学

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

这个问题很常见。原因就是因为我们做chip-seq的时候，富集下来的dna量比较少。所以这个时候还按照正常的sop的量去加接头，就好产生很多的接头污染。所以可以选择减少接头的量，降低pcr引物的量，可以有效的降低最后的文库的接头的数量。同时可以进行dna磁珠的纯化。

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