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R+HiC

新虫 (初入文坛)

[交流] 测序结果文库接头污染是什么问题? 已有1人参与

做HiC或者Chip中发现测序的文库接头中接头污染,导致文库不合格如何解决

发自小木虫IOS客户端
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atikou

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个问题很常见。原因就是因为我们做chip-seq的时候,富集下来的dna量比较少。所以这个时候还按照正常的sop的量去加接头,就好产生很多的接头污染。所以可以选择减少接头的量,降低pcr引物的量,可以有效的降低最后的文库的接头的数量。同时可以进行dna磁珠的纯化。
2楼2022-03-29 22:27:52
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