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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 做了BLAST后，图中三段比对后的小写字母是什么意思啊，求解答
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af不变

铜虫 (小有名气)

[求助] 做了BLAST后，图中三段比对后的小写字母是什么意思啊，求解答 已有1人参与

做了BLAST后，图中三段比对后的小写字母是什么意思啊，求解答。

做了BLAST后，图中三段比对后的小写字母是什么意思啊，求解答
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1楼 2017-11-08 13:07:25
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厄瑞斯

铜虫 (初入文坛)
应该是简单重复和低复杂度序列吧。

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af不变
2楼2017-11-08 13:23:50
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af不变

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 厄瑞斯 at 2017-11-08 13:23:50
应该是简单重复和低复杂度序列吧。

还是有些不太懂，可否详细讲解一下？
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3楼2017-11-08 15:22:21
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厄瑞斯

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by af不变 at 2017-11-08 15:22:21
还是有些不太懂，可否详细讲解一下？...

在核苷酸或蛋白质有一些短的重复序列或者由少数几种核苷酸或者氨基酸残基组成的序列。例如Poly-A这种的序列。在比对几条序列的相似性时，这种序列会影响比对结果，所以一般都过滤掉。

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4楼2017-11-08 20:25:40
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