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晋鹏

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[交流] [优秀文章推荐]水稻穗型与产量基因表达调控研究获新突破 已有3人参与

[优秀文章推荐]水稻穗型与产量基因表达调控研究获新突破


中国科学家发现水稻的穗发育基因(FRIZZY PANICLE,FZP)在自然界中发生变异,可显著增加水稻每穗的粒数和轻微降低每粒的粒重,使水稻产量增加15%。基因表达调控是最重要的生物学现象之一,许多重要农艺性状都受基因表达调控。基因表达调控元件,如“增强子”在玉米、水稻以及拟南芥等植物中均有报道。然而“沉默子”在植物中报道极为少见。本课题组通过近十年的研究,在水稻重要穗型发育基因FZP起始密码子上游5.3 kb处鉴定到一个沉默子(18-bp的DNA序列),该沉默子的拷贝数变异调控FZP基因的表达,影响水稻每穗颖花数与千粒重/粒形,进而调控产量;进一步研究发现转录因子OsBZR1可结合该沉默子抑制下游基因FZP表达从而增加产量。

[优秀文章推荐]水稻穗型与产量基因表达调控研究获新突破-1


本课题组利用粒形差异巨大的水稻亲本材料川7和豪博卡构建的重组自交系群体,在第7染色体末端定位到一个同时控制每穗颖花数、千粒重与粒长的QTL(2010, BMC Genet)。研究人员通过精细定位将该QTL限定在一个17.8-kb区段,发现该区间与上述3性状共分离,该区间只包含2个候选基因。研究人员将2个候选基因分别进行转基因或者突变体验证功能,均未能证实它们是候选基因。通过进一步分析该区间两亲本序列,研究人员发现存在一个18-bp的插入/缺失的位点,它位于穗发育基因FZP的上游,极有可能参与调控FZP的表达。研究人员将FZP基因序列与上游含5.3 kb的整个8.3-kb DNA序列克隆并进行了遗传互补转化验证,证实候选基因为FZP,功能位点为18-bp的多态位点。该18-bp序列可能是一个沉默子,它抑制下游FZP表达。FZP是重要的发育基因,它的功能缺失导致小花发育受阻,不能产生正常的种子。该课题组前期研究发现,FZP的编码序列在自然资源里并不存在蛋白功能变异(2016,SREP)。自然界可能存在FZP的表达量变异,这种变异可能就是由这18-bp调控的。

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该抑制是如何实现的呢?其分子调控机制是什么?这是摆在研究人员面前的又一科学问题。研究人员通过对该18-bp序列的motif结构分析,也尝试了酵母筛库,同时查阅文献。最终得出OsBZR1可能是该沉默子的结合靶蛋白。进而通过系列实验在体内与体外证实它们存在互作,并进一步验证了OsBZR1通过结合该沉默子对下游报告基因具有转录抑制功能。2个拷贝的沉默子降低FZP表达量,每穗粒数显著增加,千粒重略微降低,但稻米垩白率与垩白度显著降低,提高了稻米蒸煮品质,产量显著增加。多套近等基因系及RNAi转基因材料产量数据表明:该沉默子通过抑制FZP表达使水稻单株产量增加15%以上,但不影响开花期。这与该小组之前克隆的Ghd系列基因增产但延长开花期不同。

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该沉默子具有增产和改善稻米品质的潜能,它是否很好地用于水稻育种呢?研究人员通过对529份世界水稻核心种质材料测序分析发现该18-bp插入仅仅发生在东南亚的部分Aus品种中,说明这个突变起源于Aus品种,并未在我国主流高产品种中加以应用。因此,该等位基因在我国具有极高的增产育种应用前景。
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星风作浪

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2楼2017-11-05 22:03:42
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Jackywen

铁杆木虫 (著名写手)


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《爱你真好难》--李玲玉;《爱江山更爱美人》--李惠芬。
3楼2017-11-06 01:03:18
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晋鹏

版主 (知名作家)

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3楼: Originally posted by Jackywen at 2017-11-06 01:03:18
能发一下文章的链接吗?

doi:10.1038/s41477-017-0042-4
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4楼2017-11-06 08:06:04
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sdaucf

铁虫 (著名写手)

晋鹏: 鼓励回帖交流,欢迎常来农林板块分享你的心得~ 2017-11-08 08:14:02
脚踏实地
5楼2017-11-07 14:18:31
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