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S嘻嘻哈哈

新虫 (正式写手)

[交流] 蛋白3D

谁会做蛋白质三级结构的3D图呀，可以标碱基的，跪求

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1楼 2017-11-03 16:12:38
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莫落

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这个真不会，主要是碱基不知道在哪标，标氨基酸的话可以用pymol

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2楼2017-11-03 16:58:35
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Angle_Hebe

木虫 (正式写手)
需要做什么？

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3楼2017-11-03 17:01:32
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Angle_Hebe

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
简单点我可以试试帮你做一下。

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4楼2017-11-03 17:02:04
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S嘻嘻哈哈

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Angle_Hebe at 2017-11-03 17:02:04
简单点我可以试试帮你做一下。

我的是两个氨基酸序列的比对，也想把他们三级结构的差异给标出来，所以想做个3D图，我用swiss~pdb软件添加两个序列的pdb格式的三级结构图，序列差异很大，可是这两个相比，缺失了9个碱基，也就是三个氨基酸，让我很郁闷

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5楼2017-11-03 18:33:43
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S嘻嘻哈哈

新虫 (正式写手)
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2楼: Originally posted by 莫落 at 2017-11-03 16:58:35
这个真不会，主要是碱基不知道在哪标，标氨基酸的话可以用pymol

这是个软件还是网址，不懂欸

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6楼2017-11-03 18:34:31
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莫落

木虫 (正式写手)
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6楼: Originally posted by S嘻嘻哈哈 at 2017-11-03 18:34:31
这是个软件还是网址，不懂欸
...

我可以试试，把pdb id给我

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7楼2017-11-03 19:00:58
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Angle_Hebe

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by S嘻嘻哈哈 at 2017-11-03 18:33:43
我的是两个氨基酸序列的比对，也想把他们三级结构的差异给标出来，所以想做个3D图，我用swiss~pdb软件添加两个序列的pdb格式的三级结构图，序列差异很大，可是这两个相比，缺失了9个碱基，也就是三个氨基酸，让我很 ...

还好，不算麻烦，有pdb文件吗？

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8楼2017-11-03 19:13:13
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S嘻嘻哈哈

新虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by Angle_Hebe at 2017-11-03 19:13:13
还好，不算麻烦，有pdb文件吗？
...

有，pdb文件是我在swiss~model网站上输入氨基酸序列得到的。明天给你发吧，辛苦了

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9楼2017-11-03 21:55:37
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