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gonghf07

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何用counterpoise计算BSSE?

【求助】如何用counterpoise计算BSSE?具体怎么操作这个关键词,再问这个关键词能用于计算金属的BSSE吗?十分感谢!
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yuhuobuku

木虫 (正式写手)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 2-24 10:09
总有人问这个问题呢
本版搜索,我就给别人回答过三四次了。
薄酒可以忘忧,丑妻可以白头,徐行不必驷马,称身不必狐裘平淡才是生活的主旋律
2楼2009-02-22 13:11:09
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loovfnd

至尊木虫 (著名写手)

我搜索了一下,没见到有算BSSE的,楼上在给讲一遍吧。
莫强求!
3楼2009-02-22 16:40:38
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yuhuobuku

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
xuefei06(金币+5,VIP+0):thanks! 2-23 00:22
引用回帖:
Originally posted by loovfnd at 2009-2-22 16:40:
我搜索了一下,没见到有算BSSE的,楼上在给讲一遍吧。

举个例子,比如计算AB体系的BSSE矫正:
需要得出的五个能量分别是:
第一个是整体的能量E(AB)
第二个是单独计算A的能量E(A)
第三个是单独计算B的能量E(B)
第四个是计算在AB基组下,A的能量E(A/AB)
第五个是计算在AB基组下,B的能量E(B/AB)

那么,BSSE energy =E(A)+E(B)-E(A/AB)-E(B/AB)。计算E(A/AB)的基函数是计算AB的基函数,而计算E(A)的基函数只是计算AB基函数的一部分,基函数越多,能量计算的越准确,能量计算越准确,就越低,所以E(A/AB) 所以经过矫正的结合能由于加上了一个BSSE energy,并且这个值是大于零的,所以矫正后的结合能要比没矫正前的结合能大。

输出文件里面5个scf第一个是整体的能量(记为E(AB)),后面4个是单体能量,分别是2个部分在整体基组和各自基组下的能量。

我当时是用-Bq原子算的BSSE矫正, 估计你是用CP方法吧。但原理都是一样的。

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1099266
薄酒可以忘忧,丑妻可以白头,徐行不必驷马,称身不必狐裘平淡才是生活的主旋律
4楼2009-02-22 18:03:05
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yuhuobuku

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
xuefei06(金币+3,VIP+0):thanks! 2-23 00:23
引用回帖:
Originally posted by loovfnd at 2009-2-22 16:40:
我搜索了一下,没见到有算BSSE的,楼上在给讲一遍吧。

用counterpoise关键字:
#uB3LYP/6-31G Counterpoise=2 SCF=(tight)

C2 +  NO --> C2NO  

0 2 0 1 0 2
C        0.000000    1.600184    0.000000 1
C        0.000000    0.960265    0.000000 1
N        0.208401    3.031919    0.000000 2
O        1.164068    3.666273    0.000000 2

0 2 0 1 0 2分别代表总体系电荷和多重度,片段一的电荷和多重度,片段二的电荷和多重度。

分子坐标后的1和2是定义的片段

用Bq原子:
# b3lyp/3-21G** nosymm scf=tight test

HBr + H2O manual counterpoise calculation, H2O removed

0  1
H       0.685176   -0.004924   -0.026973
Br     -0.771917    0.000050    0.001967
O-Bq    2.536864   -0.000136   -0.051401
H-Bq    3.015128    0.789231    0.184042
H-Bq    3.021888   -0.784986    0.185282

这就相当于用HBr + H2O的基组计算HBr
薄酒可以忘忧,丑妻可以白头,徐行不必驷马,称身不必狐裘平淡才是生活的主旋律
5楼2009-02-22 18:11:38
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loovfnd

至尊木虫 (著名写手)

十分感谢,版主,我记下来了。
莫强求!
6楼2009-02-25 09:20:11
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suny2005

木虫 (小有名气)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 2-27 22:05
在这里修正一下,校正后的相互作用能应该为Eb2=Eb1-BSSE energy
7楼2009-02-27 08:20:40
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zhangji3013

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by suny2005 at 2009-2-27 08:20:
在这里修正一下,校正后的相互作用能应该为Eb2=Eb1-BSSE energy

到底该听谁的?
8楼2009-02-27 08:59:58
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yuhuobuku

木虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 2-27 22:05
引用回帖:
Originally posted by zhangji3013 at 2009-2-27 08:59:

到底该听谁的?

自己按上面的推导过程推导一下呗
就是简单的加减法
薄酒可以忘忧,丑妻可以白头,徐行不必驷马,称身不必狐裘平淡才是生活的主旋律
9楼2009-02-27 09:15:25
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yuhuobuku

木虫 (正式写手)

★ ★
jghe(金币+2,VIP+0):感谢你参与讨论! 2-27 20:24
引用回帖:
Originally posted by zhangji3013 at 2009-2-27 08:59:

到底该听谁的?

用加减法都是一回事,因为BSSE本身是个差值。前者减后者,后者减前者,就差一个负号的关系。
薄酒可以忘忧,丑妻可以白头,徐行不必驷马,称身不必狐裘平淡才是生活的主旋律
10楼2009-02-27 09:23:37
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