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chshengyao

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】构象问题

各位达人,我在做环状化合物的计算时,对中环及大环(如七元环向上)化合物的构象深感疑惑.构象搜寻(主要是最低能量构象)用什么软件做,如何做?哪位虫友能给个建议?

[ Last edited by xuefei06 on 2009-2-23 at 00:06 ]
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才


xuefei06(金币+1,VIP+0):thanks! 2-23 00:06
引用回帖:
Originally posted by chshengyao at 2009-2-22 08:43:
各位达人,我在做环状化合物的计算时,对中环及大环(如七元环向上)化合物的构象深感疑惑.构象搜寻(主要是最低能量构象)用什么软件做,如何做?哪位虫友能给个建议?

是的 用高斯的频率分析
我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
3楼2009-02-22 23:48:15
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)


xuefei06(金币+1,VIP+0):thanks! 2-23 00:05
好像没有这样的软件吧,呵呵

你可以构造不同的构象,然后去优化的啊,用高斯

哪个能量低,就是最稳定的啦
2楼2009-02-22 23:21:09
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢建议 2-24 10:00
我也遇到过类似问题,由于环与环之间的能垒较高,所以一般的构象搜索方法很难得到相对较多的构象集,你可以尝试用模拟退火的算法进行构象搜索。
4楼2009-02-24 08:34:17
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